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oncomine数据库

发布时间: 2022-04-20 19:57:24

① 怎么知道一个基因是否在某一肿瘤细胞中表达

人类结构基因4个区域:①编码区,包括外显子与内含子;②前导区,位于编码区上游,相当于RNA5’末端非编码区(非翻译区);③尾部区,位于RNA3’编码区下游,相当于末端非编码区(非翻译区);④调控区,包括启动子和增强子等。基因编码区的两侧也称为侧翼顺序

② 求助关于ONCOMINE数据库

您好,我来为您解答:
ONCOMINE数据库

收费的,要用国外的邮箱才可以注册的!

要用非盈利科研机构的邮箱才可以注册,比如科研院所。大部分数据是免费的
希望我的回答对你有帮助。

③ 如何查找某个基因或蛋白在各组织器官的表达分布

TIMER、oncomine,GEPIA数据库均可

④ oncomine数据库关闭

1)选择“文件”选项卡,单击“关闭数据库”命令。
2)选择“文件”选项卡,单击“退出”命令。
3)单击数据库窗口标题栏的“关闭”按钮。
4)双击“控制”按钮5)按Alt+F4组合键

⑤ 如何快速掌握TCGA数据库

参加培训班——最快速的方法。有些生物信息公司会针对高校教师和医师开生信培训班,我导师带着我上过几次,有TCGA、Oncomine和R的。缺点是价格贵,一次一天两三千,优点是上手快,而且会有后续服务,比如课上完后你在qq群里提问,一般公司技术人员都会给你解决。我放几张上完培训班后发的资料,是课上PPT转的PDF。另外再推荐一本中文教材,可以做补充用。优点是浅显易懂,缺点是不够深入且作者态度傲娇,但书还可以,《R语言与Bioconctor-生物信息学应用》,随着大数据时代的到来,各种生物类公共数据库井喷,其中就包括癌症领域熟为人知的癌症基因图谱The Cancer Genome Atlas (TCGA)数据库。TCGA由NCI牵头,作为美国攻克癌计划的一个大项目,投入了巨大的人力和物力,系统提供了癌症多组学测序和芯片数据,包括Gene expression, DNA methylation, Copy NumberVariation, Mutation等结果,同时也附有相应各测序样本的完整临床资料。TCGA为肿瘤基础医学和转化医学研究者提供了海量的基因组数据和与其关联的临床数据,这为挖掘有意义的基因组变化和发现影响肿瘤起始、发展、分化、转移等生物学机制提供了海量数据基础。然而传统的基础医学和转化医学研究者缺乏信息学基础来处理大规模癌症数据,因而在面对这些极其有价值的基因组数据时,往往心有余而力不足。作为医学信息领域研究者,我们需要将信息学和统计学知识运用到癌症基因组学数据分析的研究当中,作为连接大数据与基础医学研究者之间的一个纽带,帮助研究者去更好地挖掘探索这些数据。

⑥ oncomines 数据库中no value 组代表什么标本

根据名称是无数值或者无价值 无意义的标本吧。

⑦ swab和pcr有分别吗

有的。
TIMER数据库对单基因的差异分析,尤其是与肿瘤浸润免疫细胞表型相关的分析,特别适用,可以做到统筹兼顾,有局部聚焦oncomine和全局通览。
mRNA水平研究表达差异,而人类蛋白组数据库Human则是主要从蛋白也有mRNA角度展示基因表达的差异。

⑧ oncomine数据库怎样比较两个基因的相关性

第一,A的表达产物可能是B的转录因子,直接调节B,反之亦有可能; 第二,A的表达产物间接调控B的转录,或反之; 实验设计, 首先必须要确定两者的相关性,不管是正的还是负的,可用wenstern和Qpcr的手段; 其次,要从文献中或信号转导通路中挖掘。

⑨ pan-cancer的基因表达在哪个数据库

数据库名称:Oncomine数据库。
基因表达差异分析(通过检索基因表达谱差异,挖掘具有研究价值的靶分子,检索特定研究靶分子,分析其在肿瘤中的表达情况),多基因共表达分析,Oncomine和TCGA相比的优势就是,它除了数据,还提供了一些简洁易操作的分析工具,如差异表达分析、共表达分析等,分析后可以直接出图用在文章里。另外它还整合了TCGA和GEO的部分数据。

⑩ 求助关于ONCOMINE数据库

您好,很高兴为您解答:
由于您没有提出实质的问题,所以无法给予您更详细的回复,请您详细的描述出现的问题,这样才可以根据您的具体情况及出现的问题,提出针对性的解决方案。
希望以上信息可以帮到您!

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