酵母数据库

Ⅰ 如何从酿酒酵母基因组中分离ars序列

酿酒酵母是与人类关系最广泛的一种酵母，不仅因为传统上它用于制作面包和馒头等食品及酿酒，在现代分子和细胞生物学中用作真核模式生物，其作用相当于原核的模式生物大肠杆菌。酿酒酵母是发酵中最常用的生物种类。酿酒酵母的细胞为球形或者卵形，直径5–10 μm。其繁殖的方法为出芽生殖。 [编辑本段]酵母生活史酵母的细胞有两种生活形态，单倍体和二倍体。单倍体的生活史较简单，通过有丝分裂繁殖。在环境压力较大时通常则死亡。二倍体细胞（酵母的优势形态）也通过简单的有丝分裂繁殖，但在外界条件不佳时能够进入减数分裂，生成一系列单倍体的孢子。单倍体可以交配，重新形成二倍体。酵母有两种交配类型，称作a和α，是一种原始的性别分化，因此很有研究价值。 [编辑本段]酿酒酵母基因组 酿酒酵母是第一个完成基因组测序的真核生物，测序工作于1996年完成。 酿酒酵母的基因组包含大约1200万碱基对，分成16组染色体，共有6275个基因，其中可能约有5800个真正具有功能。据估计其基因约有23%与人类同源。酵母基因组数据库包含有酵母基因组的详细注释(annotation)，是研究真核细胞遗传学和生理学的重要工具。另一个重要的酿酒酵母数据库[1]由慕尼黑蛋白质序列信息中心维护。 [编辑本段]在科学中的作用 因为酿酒酵母与同为真核生物的动物和植物细胞具有很多相同的结构，又容易培养，酵母被用作研究真核生物的模式生物，也是目前被人们了解最多的生物之一。在人体中重要的蛋白质很多都是在酵母中先被发现其同源物的，其中包括有关细胞周期的蛋白、信号蛋白和蛋白质加工酶。 酿酒酵母也是制作培养基中常用成分酵母提取物的主要原料。

Ⅱ 怎么利用ura3筛选酿酒酵母端粒控制基因

酿酒酵母是第一个完成基因组测序的真核生物，测序工作于1996年完成。酿酒酵母的基因组包含大约1200万碱基对，分成16组染色体，共有6275个基因，其中可能约有5800个真正具有功能。据估计其基因约有23%与人类同源。酵母基因组数据库包含有酵母基因组的详细注释（annotation），是研究真核细胞遗传学和生理学的重要工具。另一个重要的酿酒酵母数据库[1]由慕尼黑蛋白质序列信息中心维护。在酿酒酵母测序计划开始之前，人们通过传统的遗传学方法已确定了酵母中编码RNA或蛋白质的大约2600个基因。通过对酿酒酵母的完整基因组测序，发现在12068kb的全基因组序列中有5885个编码专一性蛋白质的开放阅读框。这意味着在酵母基因组中平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因，即整个基因组有72%的核苷酸顺序由开放阅读框组成。这说明酵母基因比其它高等真核生物基因排列紧密。如在线虫基因组中，平均每隔6kb存在一个编码蛋白质的基因；在人类基因组中，平均每隔30kb或的碱基才能发现一个编码蛋白质的基因。酵母基因组的紧密性是因为基因间隔区较短与基因中内含子稀少。酵母基因组的开放阅读框平均长度为1450bp即483个密码子，最长的是位于Ⅻ号染色体上的一个功能未知的开放阅读框（4910个密码子），还有极少数的开放阅读框长度超过1500个密码子。在酵母基因组中，也有编码短蛋白的基因，例如，编码由40个氨基酸组成的细胞质膜蛋白脂质的PMP1基因。此外，酵母基因组中还包含：约140个编码RNA的基因，排列在Ⅻ号染色体的长末端；40个编码SnRNA的基因，散布于16条染色体；属于43个家族的275个tRNA基因也广泛分布于基因组中。表1提供了酵母基因在各染色体上分布的大致情况。表1酵母染色体简况染色体编号长度（bp）基因数tRNA基因数I23×103894Ⅱ80718841013Ⅲ315×10318210Ⅳ153197479627V56920227113Ⅵ270×10312910Ⅶ109093657233Ⅷ561×10326911Ⅸ43988622110X74544237924Ⅺ66644833116Ⅻ107817153422ⅫI92443045921ⅪV78432841915XV109228356020XⅥ94806148717序列测定揭示了酵母基因组中大范围的碱基组成变化。多数酵母染色体由不同程度的、大范围的GC丰富DNA序列和GC缺乏DNA序列镶嵌组成。这种GC含量的变化与染色体的结构、基因的密度以及重组频率有关。GC含量高的区域一般位于染色体臂的中部，这些区域的基因密度较高；GC含量低的区域一般靠近端粒和着丝粒，这些区域内基因数目较为贫乏。Simchen等证实，酵母的遗传重组即双链断裂的相对发生率与染色体的GC丰富区相耦合，而且不同染色体的重组频率有所差别，较小的Ⅰ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅸ号染色体的重组频率比整个基因组的平均重组频率高。酵母基因组另一个明显的特征是含有许多DNA重复序列，其中一部分为完全相同的DNA序列，如rDNA与CUP1基因、Ty因子及其衍生的单一LTR序列等。在开放阅读框或者基因的间隔区包含大量的三核苷酸重复，引起了人们的高度重视。因为一部分人类遗传疾病是由三核苷酸重复数目的变化所引起的。还有的DNA序列彼此间具有较高的同源性，这些DNA序列被称为遗传丰余（geneticrendancy）。酵母多条染色体末端具有长度超过几十个kb的高度同源区，它们是遗传丰余的主要区域，这些区域至今仍然在发生着频繁的DNA重组过程。遗传丰余的另一种形式是单个基因重复，其中以分散类型最为典型，另外还有一种较为少见的类型是成簇分布的基因家族。成簇同源区（clusterhomologyregion，简称CHR）是酵母基因组测序揭示的一些位于多条染色体的同源大片段，各片段含有相互对应的多个同源基因，它们的排列顺序与转录方向十分保守，同时还可能存在小片段的插入或缺失。这些特征表明，成簇同源区是介于染色体大片段重复与完全分化之间的中间产物，因此是研究基因组进化的良好材料，被称为基因重复的化石。染色体末端重复、单个基因重复与成簇同源区组成了酵母基因组遗传丰余的大致结构。研究表明，遗传丰余中的一组基因往往具有相同或相似的生理功能，因而它们中单个或少数几个基因的突变并不能表现出可以辨别的表型，这对酵母基因的功能研究是很不利的。所以许多酵母遗传学家认为，弄清遗传丰余的真正本质和功能意义，以及发展与此有关的实验方法，是揭示酵母基因组全部基因功能的主要困难和中心问题。

Ⅲ 基因组数据库的酵母数据库

酵母基因组数据库SGD（Cherry et al.,1998）是已经完成基因组全序列测定的啤酒酵母基因组数据库资源，包括啤酒酵母的分子生物学及遗传学等大量信息。通过因特网可以访问该数据库的全基因组信息资源，包括基因及其产物，一些突变体的表型，以及各种有关的注释信息。酵母基因组是于1998年完成基因组全序列测定的第一个真核生物基因组，其重要性不言而喻。SGD将各种功能集成在一起，生物学家可通过该数据库进行序列的同源性搜索，对基因序列进行分析，注册酵母基因名称，查看基因组的各类图谱，显示蛋白质分子的三维结构，设计能够有效克隆酵母基因的引物序列等。该数据库通过方便实用、形象生动的图形界面为用户提供酵母基因组的物理图谱、遗传图谱和序列特性图谱等信息。

Ⅳ 如何在数据库中查询酵母蛋白所编码的cDNA

NCBI NCBI下有很多数据库，以下是蛋白质序列 PopSet包含研究一个人群、一个种系发生或描述人群变化的一组组联合序列。PopSet既包含核酸序列数据又包含蛋白质序列数据。 Entrez 功能强大，在于它的大多数记录可相互链接，既可在同一数据库内链接...

Ⅳ SGD是什么意思

SGD的全称是Singapore Dollar，意思是新加坡元，主要流通于新加坡，同时流通于文莱。

新加坡元是新加坡的法定货币，以S$标记，分纸币和硬币，近期也开始发行塑胶币。目前在新加坡流通的新加坡货币有：10000、1000、100、50、10、5、1元等面额的纸币，另有1元及50、20、10、5分铸币，一元可被细分为10角（也称为“毛”）或者100分（cent）。

新加坡元的发展历史：

1、1965年8月9日新加坡宣告独立，12月22日成立共和国，但仍使用马来亚元。法定汇率为8.5142马元等于1英镑， 3.06122马元等于1美元。

2、1967年6月12日，原联合“货币基金委员会”停止发行马来亚币，新加坡政府发行了自己的新加坡元，取代了马来亚元，新加坡元与马来亚元等值。

3、1967年11月18日，英镑贬值，19日新加坡宣布新元含金量不变。

4、1971年12月18日美元贬值后，新元含金量仍不变。

5、1972年6月23日，英镑浮动后，新加坡元不再钉住英镑，改与美元挂钩。

6、1973年6月20日新加坡实行浮动的实际汇率制。

(5)酵母数据库扩展阅读：

新加坡元的兑换途径：

1、国内银行兑换，

可在国内中国银行兑换成新加坡元或美元，或是到新加坡以后兑换，美元可在新加坡直接用于消费，可以在机场、牛车水等地兑换。

2、在新加坡兑换，

新加坡可在银行、旅馆及其它任何标有“特许货币兑换处”兑换货币。大多数购物中心设有特许货币兑换处。用支票兑换现金时需出示护照，并要缴纳少量的手续费。

3、银联卡ATM取款，

只要有银联标的ATM都可以取，出来的是新币，不会是RMB的，在新加坡ATM泛滥，超级方便如果是银联标志的，有些银行是不需要手续费的。

参考资料来源：网络-新加坡元

Ⅵ 如何在酵母数据库中通过蛋白序列blast得到氨基酸序列

可能你对这个不是很了解，你可以上ncbi的主页找到blast
然后选择blast
需要输入你的序列，选择你需要的库就可以了，会得出很多已经获得的相似的核苷酸序列

Ⅶ 人类与酵母菌有多少基因相似

酿酒酵母的基因组包含大约1200万碱基对，分成16组染色体，共有6275个基因，其中可能约有5800个真正具有功能。据估计其基因约有23%与人类同源（相似）。酵母基因组数据库包含有酵母基因组的详细注释（annotation），是研究真核细胞遗传学和生理学的重要工具。另一个重要的酿酒酵母数据库由慕尼黑蛋白质序列信息中心维护。

Ⅷ 为什么很多动物进化到顶峰，突然灭绝

酿酒酵母是第一个完成基因组测序的真核生物，测序工作于1996年完成 。
酿酒酵母的基因组包含大约1200万碱基对，分成16组染色体，共有6275个基因，其中可能约有5800个真正具有功能。据估计其基因约有23%与人类同源。酵母基因组数据库包含有酵母基因组的详细注释（annotation），是研究真核细胞遗传学和生理学的重要工具。另一个重要的酿酒酵母数据库[1]由慕尼黑蛋白质序列信息中心维护。
在酿酒酵母测序计划开始之前，人们通过传统的遗传学方法已确定了酵母中编码RNA或蛋白质的大约2600个基因。通过对酿酒酵母的完整基因组测序，发现在12068kb的全基因组序列中有5885个编码专一性蛋白质的开放阅读框。这意味着在酵母基因组中平均每隔2kb就存在一个编码蛋白质的基因，即整个基因组有72%的核苷酸顺序由开放阅读框组成。这说明酵母基因比其它高等真核生物基因排列紧密。

Ⅸ 酵母属于什么类别的添加剂

酵母是食品。酵母是一种微生物。酵母（拼音：中国大陆：jiàomǔ、台湾：xiàomǔ；注音：中国大陆：ㄐㄧㄠˋ ㄇㄨˇ、台湾：ㄒㄧㄠˋ ㄇㄨˇ；英文：Yeast）是非分类学术语，泛指能发酵糖类的各种单细胞真菌，不同的酵母菌在进化和分类地位上有异源性。酵母菌种类很多，已知的约有56属500多种。

一些酵母菌能够通过出芽的方式进行无性生殖，也可以通过形成孢子的形式进行有性生殖。酵母经常被用于酒精酿造或者面包烘培行业。目前已知有1500多种酵母，大部分被分类到子囊菌门。酵母菌属兼性厌氧菌。

(9)酵母数据库扩展阅读

用于酿造啤酒的酵母菌，根据发酵类型的不同，主要分为两大类：爱尔酵母（aleyeast）与拉格酵母(窖藏酵母)（lageryeast）。

爱尔酵母发酵期间会慢慢上升至啤酒表层，因此又称顶层发酵酵母（topfermentingyeast）。

最常用的爱尔酵母为啤酒酵母（Saccharomycescerevisiae）。

由爱尔酵母发酵的啤酒有：爱尔啤酒、麦啤、司陶特（stouts）等。

拉格酵母(窖藏酵母)用于底层发酵（bottomfermentation）。

与顶层发酵方法相比，底层发酵往往采用较低的发酵温度，发酵时间较长。

到发酵末期，酵母菌下沉于酒桶底部，由此啤酒酒色也较为透明。

卡尔斯博酵母（Saccharomycescerevisiae）是一种典型与比较常用的拉格酵母(窖藏酵母)之一。

现在，爱尔酵母与拉格酵母(窖藏酵母)已被重新归类于S.cerevisae菌属。

此外，还有许多种类的酵母菌应用在酒精酿制中，以适应不同工艺与口感风味上的需要。

目前。

各种各样的育种技术被引进到优良菌种的选育中；基因工程菌技术的加入，赋予了酵母菌自然菌种所不具备的新特性。

有研究称，转入黑曲霉菌葡萄糖淀粉酶基因的酵母工程菌，能够更高效的分解利用原来中的淀粉。