欧洲数据库
发布时间: 2025-03-11 23:13:53
Ⅰ EBI主要服务
欧洲生物信息研究所(EBI)作为全球生物信息学服务的重要节点,拥有超过20年的丰富经验。作为欧洲的生物数据收集和传播中心,他们致力于维护和提供广泛的免费生物信息服务。EBI的核心数据库包括:ENA(核酸序列数据库),Ensembl(基因组数据库),ArrayExpress(基因表达数据),UniProtKB(蛋白质序列),InterPro(蛋白质家族/域/蛋白指纹),以及PDBe(大分子结构数据库)。
ENA起源于EMBL-Bank核酸序列数据库,是欧洲最重要的核酸资源,与美国NCBI的GenBank和日本DDBJ共同构成国际核酸序列数据库联盟(INSDC)。这些数据库每天实时更新,共同收录全球报道的生物序列数据。此外,EBI还新增了IntAct(蛋白质相互作用)、Reactome(反应途径)、ChEBI(小分子)等数据资源,帮助研究人员理解生命体系的分子构造和它们之间的相互作用。
除了上述数据库,EBI还提供了文献数据库、专利数据资源、BioModels和Gene Ontology等,满足了研究者在不同领域的信息需求。所有这些服务都遵循着一致的高质量标准,旨在为全球科研人员提供便捷的生物信息检索和分析工具。例如,数据获取工具SRS(序列检索系统)提供了一个直观、高效的界面,用户可以搜索超过400个本地和公共数据库,涉及多种生命科学数据类型,如FASTA、BLAST和WU-BLAST序列比对工具,以及蛋白质功能分析、序列多重比对、进化树分析和大分子结构分析等。
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