hla数据库
❶ HLA的医学价值
与器官移植
HLA的研究原先是在器官移植研究推动下开展起来的。
故此,HLA又称移植抗原。临床实践表明,同种异体移植(除同卵双生子外)的排斥应是成功率的最大障碍。在遗传学中,MHC是作为一个单位孟德尔式传递的。因此,同胞之间可有HLA相同、半相同和不同3种情况。实践证明,HLA相同的同胞供者的肾移植,90%以上效果良好;单体型不同的供者,效果明显下降;两单型皆不同者则很少存活。HLA本质和功能的揭示,为移植配型提供了重要的理论依据。可以说,器官移植是当代医学一项重要成就。
作为某些疾病的遗传标志
1972年Russel第一个报告银屑病(牛皮癣)患者携带HLA-B13或HLA-B17。此后陆续发现大量其它疾病与特定的HLA相关,其中,HLA-B27抗原见于大约90%的强直性脊椎炎病人,以至使HLA分型具有了诊断价值,甚至,能较早地证实疾病亚型之间的临床区别,例如,寻常银屑病与HLA相关,而脓疱性银屑病则不然;青少年性胰岛素依赖型糖尿病与HLA-B8、HLA-Bw15和HLA-B18相关,而晚期发作型糖尿病并无这种相关。因此,特定类型的HLA便成为某些疾病的遗传标志。例如,常染色体隐性遗传的肾上腺皮质增生症是由于21-羟化酶缺乏。应用HLA抗原多态性作群体关联分析和家系连锁分析,发现有两个羟化酶位点(21-OHA和21-OHB)与HLA-B、DR紧密连锁。依此,可用HLA作出产前诊断。在优生学中,可以根据现有资料,对某些疾病推算出孩子患病的相对风险率。另一方面,关于HLA与长寿的关系,亦形成一个研究热点。
与法医
HLA因其高度多态性而成为最能代表个体特异性并伴随个体终身的稳定的遗传标志,在无关个体之间HLA型别完全相同的几率级低。法医学通过HLA基因型或表型检测进行个体识别以“验明正身”,同时因其单倍型遗传特征,也是亲子鉴定的重要手段。
HLA 高分辨型技术
随着医学的发展,像白血病、地中海贫血等能用最新的基因技术进行分型检测,再寻找合适的供体进行移植治疗。目前通过HLA高分辨分型的外周血干细胞移植技术能大大提高配型效果,使患者的康复更快,更有保证。
骨髓与器官移植是治疗白血病、癌症等人类重大疾病的有效手段,而在移植过程中人类白细胞抗原(HLA),是决定移植排斥反应高低的重要因素。在进行骨髓和其它器官移植时,供者和受者之间人类白细胞抗原(HLA)相容程度越高,排斥反应的发生率就越低,移植成功率和移植器官长期存活率就越高;反之,就越容易发生排斥反应。虽然直系亲属间HLA完全匹配的概率较高,但是由于中国白血病患者多为独生子女,在骨髓库中寻找与患者HLA完全匹配的志愿者,成为发现供者的主要途径。
目前中国骨髓库中的HLA分型数据多数是低分辨的,并不能确保供者和患者的HLA真正匹配,患者往往需要和多个低分辨匹配的志愿者进行高分辨复核才能找到真正合适的供者。有的患者与数十个低分辨匹配的志愿者进行复核后,发现他们均不是合适的供者,甚至有的患者只能在HLA部分匹配的情况下就进行骨髓移植,导致术后出现严重的排斥反应,需要服用大量药物来维持生命。此外,高分辨率配型费用昂贵,如果捐髓者本人是中华骨髓库的注册志愿者,捐者和患者一次高配的费用是7200元(每人3600元),如果捐者不是注册志愿者,费用则是10000元(每人5000元),如此高的检测费用患者通常难以承受。因此,必须尽快实现“高分入库”,从根本上降低检测费用,提高HLA配型效率。
为改变目前落后的HLA匹配手段,通过高分辨分型的外周血干细胞移植技术能大大提高配型效果,使患者的康复更快,更有保证。该方法应用新一代的测序技术,只需通过一次实验就能够读取数千份样本的HLA序列数据,并一次性达到HLA分型的最高分辨率,同时还可发现新的等位基因。在检测通量、数据质量、成本控制等方面都有质的飞跃。应用这种新技术进行高分辨配型,成本不到传统技术的一半,但真正做到了“低分价格,高分数据”,能避免多次配型给患者造成的额外经济负担,也为治疗争取宝贵的时间。
最新HLA高分辨分型技术,使建立高分辨HLA数据库成为可能,不仅有利于快速准确地找到合适供者,大大地提高骨髓库的使用率,使其更好的服务于患者,而且可以为HLA的科学研究与技术创新提供基础性的数据支持。
❷ 怎么从数据库找 HLA-B*5801
您好,您这样:
DECLARE
lv_str VARCHAR2(100) :='TEST';
lv_rowid ROWID;
BEGIN
FOR lv_rec IN (SELECT TABLE_NAME,wmsys.wm_concat(COLUMN_NAME) COL
FROM USER_TAB_COLUMNS
WHERE DATA_TYPE='VARCHAR2'
GROUP BY TABLE_NAME
)
LOOP
BEGIN
EXECUTE IMMEDIATE 'SELECT ROWID FROM '||lv_rec.table_name||' WHERE '''||lv_str||''' IN ('||lv_rec.col||') AND ROWNUM=1'
INTO lv_rowid;
EXCEPTION
WHEN NO_DATA_FOUND THEN
lv_rowid := NULL;
END;
IF lv_rowid IS NOT NULL THEN
DBMS_OUTPUT.PUT_LINE('TABLE NAME='||lv_rec.table_name||' ROWID='||lv_rowid);
EXIT;
END IF;
END LOOP;
END;
/
❸ 求救~~~HLA与non-HLA基因的区别!!!急!
人类白细胞抗原(Human Leukocyte Antigen,HLA) 基因复合物位于6p21.3,有220多个不同的功能基因,是人类基因组最复杂的遗传多态系统.HLA等位基因的变异在医学、法医学、人类学等领域具有重要的意义.自从1964年以来,HLA分型一直采用经典的微量淋巴细胞毒实验,但该方法是血清学水平的分型,不能识别很多特异性的等位基因,而且高质量的抗体也不易获得.从20世纪90年代起,在国家自然科学基金的资助下,首先开展HLA Ⅱ类位点基因分型研究及大规模群体多态性调查,所获得的中国主要民族基因数据已应用于多个领域.相比之下,HLA Ⅰ类基因数量更丰富,包含了A、B、C、E、F、G和假基因H、J、K、L等10个位点;基因分子结构更复杂,更具多态性.因此,HLA Ⅰ类 DNA 分型比 HLA Ⅱ类分型有许多困难.
应该就是假基因位点吧,你可以数据库查点文献,外文的有很多关于non-HLA的,可是我实验室不能下载外文的文献,你可以自己想想办法
❹ 如何捐骨髓
捐献造血干细胞指南
怎样成为一名捐献造血干细胞的志愿者?
如果您的年龄在 18-45 周岁、身体健康、志愿捐献造血干细胞,可与所在地红十字会(资料库省级分库)联系,或在当地的献血车(站)报名。到指定地点抽取 6-8 毫升血液,经 HLA 分型检验后,把所有相关资料录入中华骨髓库的计算机数据库中。这样您就成为捐献造血干细胞的志愿者了。
填写“志愿捐献者同意书”时有什么需要特别关注的问题?
第一、要准确详实地提供个人的资料,如您的联络方式、住址、工作单位及电话、手机、电邮发生变化时,要及时通知我们。
第二、须详尽地提供两位不同住址亲友的联系地址和电话,以便在您的资料有变化时,能通过他们与您恢复联络。
捐献造血干细胞有报酬吗?
我们建立资料库的目的是满足社会的需求,提倡向社会奉献。捐献造血干细胞拯救生命也是无法用金钱来衡量的。根据国际红十字运动的宗旨和各国骨髓库的惯例,捐献造血干细胞是自愿无偿的。
何时能实现捐献造血干细胞?
18-45 岁,身体状况符合献血规定的人可以报名成为志愿者。
你的资料入库后,只有与患者的配型相合后,才能捐献。这个等待时间最长到 55 岁。
献血的同时就可以成为造血干细胞捐献的志愿者。
因符合志愿者的健康条件与献血者的相同;献血的同时留取 6-8 毫升血样很方便;特别是献成分血的感受和过程与捐献造血干细胞的基本相同。
为什么需要体检?怎么进行体检?
捐献者的血样一般是几个月或是更长时间以前留下的,而且在抽血样时也并未对志愿者进行体检,因而在配型成功后,需要对捐献者进行体检。一是为了保护捐献者,保证其在身体不适时不去捐献;二是为了对患者负责,不把带有病毒的造血干细胞捐给患者。
一旦确定捐献以后,各省分库将按照管理中心规定的体检要求,安排捐献者在指定的三甲医院进行体检。
■ 骨髓捐献的步骤:
填写中国血液在线骨髓捐献志愿者登记表;中国血液在线将把您的资料妥善保管并转交给有关组织机构。
有关组织机构将安排您在适当的时间验血(5毫升),并将化验后HLA分型储存在电脑资料库中,供患者寻找配对;
初步配型相同,骨髓库将通知您作进一步的检测;
如果配型完全相同,骨髓库的工作人员会向您详细介绍捐献过程,同时您必须接受全身检查;
捐献时您完全处于清醒状态,从您的手臂静脉中采集造血细胞(总量为50~100毫升),通过血细胞分离机富集,将剩余的血液回输人体,完全无碍健康。
如何采集造血干细胞?
由中华骨髓库管理中心通知捐献者到指定的采集地点进行采集。体检合格后,捐献者应在采集中心连续四天注射细胞动员剂。之后才是进行采集。主要是通过细胞分离机将造血干细胞从血液中分离出来,而其余血液将从另一管道输回捐献者身体。一般说来, 100-150ml 的造血干细胞混悬液就能挽救一个患者。
❺ 如何批量下载IMGT/HLA数据库 的序列
首先到JGI主页,选择一个物种,然后用Key Words search,或者Blast,找到目的序列。点这个目的序列。会出现一排目录,一个基因,一般是About this gene, Sequences,peptide Homologs, Gene Ancestry, Get Data,点Sequences就可以得到DNA,cDNA等。如果你想得到两端更长序列,还可以在Show flanking sequence调 upstream和downstream,然后点Update sequence
❻ 捐献骨髓需要什么条件
你可以去当地的血站或者是红十字会进行咨询啊~~~ 对身体要求如下:(虽然是转载来的,但希望对你有所帮助) 关于造血干细胞志愿捐献者的健康标准? 凡年龄在18-55周岁,身体健康,经下列血液检查合格者,都可以成为造血干细胞捐献者。 丙氨酸氨基转移酶(ALT)≤25单位(医院是采用≤40单位) 乙型肝炎病毒表面抗原:阴性 丙型肝炎病毒抗体:阴性 艾滋病病毒抗体:阴性 梅毒试验:阴性 以下是志愿捐献者健康状况征询表 身高: 厘米 体重:公斤(体重要求:男>=50公斤,女>=45公斤) 1.您的年龄在18~45岁之间? 是( )否( ) 2.您的健康状况良好? 是( )否( ) 3.您已了解造血干细胞捐献的全过程? 是( )否( ) 符合以上条件者,请继续回答下列问题(以上18条有一条为“是”,则就不能登记入库) : 1、是否曾患过乙型、丙型肝炎,现乙型肝炎表面抗原或丙型肝炎抗体阳性? 2、 是否曾患过敏性疾病并反复发作,如荨麻疹、支气管哮踹、药物性过敏等? 3、 是否患过结核病,如肺结核、肾结核、淋巴结核及骨结核? 4、 是否患有心血管疾病,如各种心脏病、高血压、低血压、心肌炎以及血栓性静脉炎等? 5、 是否患有呼吸系统疾病,如慢性支气管炎、肺气肿、支气管扩张、肺功能不全? 6、是否患有消化系统或泌尿系统疾病,如较重的胃及十二指肠溃疡、慢性胃肠炎、急慢性肾炎、慢性泌尿道感染、肾病综合症以及慢性胰腺炎? 7、 是否患有血液病,如贫血、白血病、真性红细胞增多症及各种出、凝血性疾病? 8、 是否患有内分泌疾病或代谢障碍性疾病,如脑垂体疾病、肾上腺疾病,甲亢、肢端肥大症、尿崩症及糖尿病? 9、 是否患有器质性神经系统疾病或精神病,如脑炎、脑外伤后遗症、癫痫、精神分裂症、癔病、严重神经衰弱症? 10、 是否患有影响健康的良性肿瘤? 11、 是否曾做过切除胃、肾、脾等重要内脏器官手术? 12、 是否患有慢性皮肤病,特别是传染病、过敏性及炎症性全身皮肤病,如广泛性湿疹及全身性牛皮癣等? 13、 是否患有眼底有病变的高度近视? 14、 是否患有自身免疫性疾病及胶原性疾病,如系统性红斑狼疮、皮肌炎、硬皮病等? 15、 是否患有性病、梅毒、麻风病、和艾滋病或是艾滋病病毒感染者? 16、 是否有过吸毒史? 17、 是否曾因患有不能献血的其他疾病而被拒绝无偿献血? 18、 是否在五年内曾输注过全血或成分血? 下面对以上各项进行一下详细说明: 关于造血干细胞志愿捐献者的健康标准? 凡年龄在18-55周岁,身体健康,经下列血液检查合格者,都可以成为造血干细胞捐献者。 (这里说的年龄范围是可以捐献的年龄,而18-45是捐献报名的年龄,这两者不冲突) 以下是志愿捐献者健康状况征询表 身高: 厘米 体重:公斤(体重要求:男>=50公斤,女>=45公斤) 对于体重的要求:一个人的血液和他的体重是成正比的,占7-8%左右,捐献造血干细胞也是献血的一种,所以参照献血标准,制定了体重要求。 1.您的年龄在18~45岁之间? 是( )否( ) 未满18周岁能否捐献问题 限制年龄可能是基于两方面的原因,一个是因为未满18岁,还不具有完全民事行为权利,因此在法律上不能独立完成捐献的;另外一个就是因为身体原因了,未满18岁身体还没有发育成熟,同时也多数体重达不到捐献的标准。 也有不满18岁捐献了,那都是在有亲缘关系的捐献中,是在万不得已的情况下的权宜之计,因此在非血缘关系捐献中是不能这样做的。 年龄上限说明 : 登记的最大年龄是45岁,但是捐献年龄是:18~55岁。因为配型成功可能要等待很久,所以登记的年龄适当减少。 2.您的健康状况良好? 是( )否( ) 不少人问到良好到底是个什么概念。我想身体正常,且没有下面所列出的18个项目就是良好吧 3.您已了解造血干细胞捐献的全过程? 是( )否( ) 符合以上条件者,请继续回答下列问题 : 1、是否曾患过乙型、丙型肝炎,现乙型肝炎表面抗原或丙型肝炎抗体阳性? 2、 是否曾患过敏性疾病并反复发作,如荨麻疹、支气管哮踹、药物性过敏等? 得过荨麻疹但是治愈了之后是可以捐献的 关于这个过敏很多人问,现在我也没有一个准确的答复,不过我想,普通的药物比如:阿司匹林、青霉素、感冒药之类的应该不在此列 3、 是否患过结核病,如肺结核、肾结核、淋巴结核及骨结核? 4、 是否患有心血管疾病,如各种心脏病、高血压、低血压、心肌炎以及血栓性静脉炎等? 5、 是否患有呼吸系统疾病,如慢性支气管炎、肺气肿、支气管扩张、肺功能不全? 6、是否患有消化系统或泌尿系统疾病,如较重的胃及十二指肠溃疡、慢性胃肠炎、急慢性肾炎、慢性泌尿道感染、肾病综合症以及慢性胰腺炎? 以上所指的病是指情况较严重的,已经影响了自己的生活情况的疾病,普通胃病等等情况不严重是没有关系的! 7、 是否患有血液病,如贫血、白血病、真性红细胞增多症及各种出、凝血性疾病? 普通的贫血不在此列,这里说的贫血是一种严重的血液病。 8、 是否患有内分泌疾病或代谢障碍性疾病,如脑垂体疾病、肾上腺疾病,甲亢、肢端肥大症、尿崩症及糖尿病? 9、 是否患有器质性神经系统疾病或精神病,如脑炎、脑外伤后遗症、癫痫、精神分裂症、癔病、严重神经衰弱症? 关于脑外伤等,是指脑组织的创伤,普通的脑部擦伤等不影响捐献。 10、是否患有影响健康的良性肿瘤? 不影响健康的良性肿瘤不在此列。 11、是否曾做过切除胃、肾、脾等重要内脏器官手术? 12、 是否患有慢性皮肤病,特别是传染病、过敏性及炎症性全身皮肤病,如广泛性湿疹及全身性牛皮癣等? 得过白癜风的不行 13、 是否患有眼底有病变的高度近视? 咨询中有不少人是高度近视,所以担心这个,其实眼底发生变化是指眼底动脉硬化、视网膜病变等等,是一个比较广泛的名称。 关于这条,我特别询问了医生,高度近视是指600度以上的近视,但是不是所有600度以上就不能捐献,它有个前提,就是眼底有病变,具体的表现是眼睛会突然失明,但是很快又好了;或者眼前感觉总有蚊子或是什么东西在飞一样;或者还有其他一些表征体现,如果是这样的情况,就不能捐献的。 14、 是否患有自身免疫性疾病及胶原性疾病,如系统性红斑狼疮、皮肌炎、硬皮病等? 15、 是否患有性病、梅毒、麻风病、和艾滋病或是艾滋病病毒感染者? 16、 是否有过吸毒史? 大麻、摇头丸、病毒、K粉、海洛因等,有吃过就不行。 17、 是否曾因患有不能献血的其他疾病而被拒绝无偿献血? 18、 是否在五年内曾输注过全血或成分血? 此条指的是因失血或手术等原因接受过全血或成分血,参加无偿献血的不在此列。 一些已经回复的问题整理如下: 感冒时候可以去验血吗? 等好了再去。 经注射过狂犬疫苗的不能捐献造血干细胞吗? 最后一次注射疫苗后的一年就可以参加献血和报名参加造血干细胞捐献 高血压: 不可以献血,也不可以登记入库。 血色素有点低可以捐献登记吗? 血色素11g以上为正常。但中国女性在10g以上都是可以接收的。这和营养、月经、锻炼等都有关。只要你不是很低都可以加入骨髓库。但要记得多锻炼身体、均衡饮食(多吃富含维生素C和叶酸的食物)。 关于大小三阳 :大小三阳都不能捐献造血干细胞。 小三阳指:表面抗原、相关抗体、核心抗体阳性。本身已经具有一定的传染性,病毒可能仍然处于复制状态,只是不象大三阳那么严重。 虽然对于本人来说,乙肝表面抗原阳性不影响身体,但是,乙肝表面抗原阳性说明身体受过乙肝病毒的感染,病毒可能潜伏在你身体,献血后把血液输给其他病人,这个病人就可能传染上乙肝病毒,甚至转化为更严重的疾病,所以,乙肝表面抗原阳性者还是不能献血和捐献造血干细胞的哦!非常感谢你的爱心,当然奉献爱心的方式有很多哦~~~ 乙肝表面抗原阴性,抗体阳性的话,那是可以报名参加造血干细胞捐献的 孕妇如果和患者相配后能否捐献: 为了保证供者的健康,如果是在怀孕期间不适合进行骨髓捐献。 患有子宫肌瘤,到底能不能捐献?是良性的话,不影响捐献。 心肌炎治愈后不影响捐献
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❼ HLA分型的技术原理
HLA高分辨分型技术与过去的低分辨相比配型速度更快,配型更精确,使得移植排斥反应更小,手术成功率和术后存活率更高。
随着医学的发展,像白血病、地中海贫血等能用最新的基因技术进行分型检测,再寻找合适的供体进行移植治疗。现通过HLA高分辨分型的外周血干细胞移植技术能大大提高配型效果,使患者的康复更快,更有保证。
骨髓与器官移植是治疗白血病、癌症等人类重大疾病的有效手段,而在移植过程中人类白细胞抗原(HLA),是决定移植排斥反应高低的重要因素。在进行骨髓和其它器官移植时,供者和受者之间人类白细胞抗原(HLA)相容程度越高,排斥反应的发生率就越低,移植成功率和移植器官长期存活率就越高;反之,就越容易发生排斥反应。虽然直系亲属间HLA完全匹配的概率较高,但是由于我国白血病患者多为独生子女,在骨髓库中寻找与患者HLA完全匹配的志愿者,成为发现供者的主要途径。
目前我国骨髓库中的HLA分型数据多数是低分辨的,并不能确保供者和患者的HLA真正匹配,患者往往需要和多个低分辨匹配的志愿者进行高分辨复核才能找到真正合适的供者。有的患者与数十个低分辨匹配的志愿者进行复核后,发现他们均不是合适的供者,甚至有的患者只能在HLA部分匹配的情况下就进行骨髓移植,导致术后出现严重的排斥反应,需要服用大量药物来维持生命。此外,高分辨率配型费用昂贵,如果捐髓者本人是中华骨髓库的注册志愿者,捐者和患者一次高配的费用是7200元(每人3600元),如果捐者不是注册志愿者,费用则是10000元(每人5000元),如此高的检测费用患者通常难以承受。因此,必须尽快实现“高分入库”,从根本上降低检测费用,提高HLA配型效率。
为改变现今落后的HLA匹配手段,现通过高分辨分型的外周血干细胞移植技术能大大提高配型效果,使患者的康复更快且效果更有保证。该方法应用新一代的测序技术,只需通过一次实验就能够读取数千份样本的HLA序列数据,并一次性达到HLA分型的最高分辨率,同时还可发现新的等位基因。在检测通量、数据质量、成本控制等方面都有质的飞跃。应用这种新技术进行高分辨配型,成本不到传统技术的一半,但真正做到了“低分价格,高分数据”,能避免多次配型给患者造成的额外经济负担,也为治疗争取宝贵的时间。
最新HLA高分辨分型技术,使建立高分辨HLA数据库成为可能,不仅有利于快速准确地找到合适供者,大大地提高骨髓库的使用率,使其更好的服务于患者,而且可以为HLA的科学研究与技术创新提供基础性的数据支持。 地中海贫血治疗
造血干细胞移植 异基因造血干细胞移植是现能根治重型Β地贫的方法。如有 HLA 相配的造血干细胞供者,;应作为治疗重型Β地贫的首选方法。
急性白血病
骨髓移植
对ANLL疗效较好。①同基因骨髓移植,供者为同卵孪生子。②同种异基因骨髓移植,供者为患者的兄弟姐妹。随着医学的发展像白血病、地中海贫血、肾衰等能用最新的基因技术进行分型检测,再寻找合适供体进行移植治疗。现今通过HLA高分辨分型的外周血干细胞移植技术能大大提高配型效果,使患者康复更快,效果更有保证。
自体骨髓移植,不需选择供者,易推广。
❽ 未满18岁可以捐献骨髓吗情况危急!!!
经法定监护人意思表示同意也可以为该行为
❾ 如何批量下载IMGT/HLA数据库 的序列
首先到JGI主页,选择一个物种,然后用Key
Words
search,或者Blast,找到目的序列。点这个目的序列。会出现一排目录,一个基因,一般是About
this
gene,
Sequences,peptide
Homologs,
Gene
Ancestry,
Get
Data,点Sequences就可以得到DNA,cDNA等。如果你想得到两端更长序列,还可以在Show
flanking
sequence调
upstream和downstream,然后点Update
sequence