pca的源码
Ⅰ PCA涓绘垚鍒嗗垎鏋愬浘镀忔暟鎹闄岖淮浠g爜姹傛暀
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Ⅱ C#中如何编写PCA算法代码
PCA的处理步骤:
1,均值化
2,求协方差矩阵(我知道的有两种方法,这是第一种,按部就班的求,第二种是:(A*A‘/(N-1)))
3,求协方差的特征值和特征向量
4,将特征值按照从大到小的顺序排序,选择其中最大的k个,然后将其对应的k个特征向量分别作为列向量组成特征向量矩阵
5,将样本点投影到选取的特征向量上
matlab实现源代码
%PCA算法,matlab实现
functionF=pcad(A,n)%A是M*N
%测试实例A=[2.5,0.5,2.2,1.9,3.1,2.3,2,1,1.5,1.1;2.4,0.7,2.9,2.2,3.0,2.7,1.6,1.1,1.6,0.9]
%结果F=[0.8280,-1.7776,0.9922,0.2742,1.6758,0.9129,-0.0991,-1.1446,-0.4380,-1.2238]
%PCA第一步:均值化
X=A-repmat(mean(A,2),1,size(A,2))%去均值
%PCA第二步:求特征协方差矩阵
B=COV(X')%求协方差
%PCA第三步:求特征协方差矩阵的特征值和特征向量
[v,d]=eig(B)%求特征值和特征向量
%PCA第四步:将特征值按照从大到小的顺序排序
d1=diag(d);%取出对角矩阵,也就是把特征值提出来组成一个新的M*1的d1矩阵
[d2index]=sort(d1);%特征值以升序排序d2是排序后的结果index是数排序以前的排名位置
cols=size(v,2);%特征向量矩阵的列数
fori=1:cols%对特征向量做相反位置的调整是个降序排列。这个过程把特征值和特征向量同时做相应的降序排列
vsort(:,i)=v(:,index(cols-i+1));%vsort是一个M*col(注:col一般等于M)阶矩阵,保存的是按降序排列的特征向量,每一列构成一个特征向量
%vsort保存的是协方差矩阵降序后的特征向量,为M*M阶
dsort(i)=d1(index(cols-i+1));%dsort保存的是按降序排列的特征值,是一维行向量,1*M
end%完成降序排列
M=vsort(:,1:n)%提取主成分量
%PCA第五步:将样本点投影到选取的特征向量上
F=(X'*M)'%最终的投影
Ⅲ 2020-07-21
主成分分析(PCA)是一种数据降维和去除相关性的方法,它通过线性变换将向量投影到低维空间。对向量进行投影就是对向量左乘一个矩阵,得到结果向量:
在这里,结果向量的维数小于原始向量的维数。降维要确保的是在低维空间中的投影能很好地近似表达原始向量,即重构误差最小化。
核心的问题的如何得到投影矩阵,和其他的机器学习算法一样,它通过优化目标函数得到。首先考虑最简单的情况,将向量投影到一维空间,然后推广到一般情况。
假设有 n 个 d 维向量 X i ,如果要用一个向量 X 0 来近似代替它们,这个向量取什么值的时候近似代替的误差最小?如果用均方误差作为标准,就是要最小化如下函数:
显然问题的最优解是这些向量的均值:
证明很简单。为了求上面这个目标函数的极小值,对它的求梯度(求导)并令梯度等于0,可以得到
解这个方程即可得到上面的结论。只用均值代表整个样本集过于简单,误差太大。作为改进,可以将每个向量表示成均值向量和另外一个向量的和:
其中, e 为单位向量, a i 是标量。上面这种表示相当于把向量投影到一维空间,坐标就是 a i 。当e和ai取什么值的时候,这种近似表达的误差最小?
这相当于最小化如下误差函数:
将上面求得的ai带入目标函数中,得到只有变量e的函数:
上式的后半部分和e无关,由于e是单位向量,因此有 ||e||=1 的约束,这个约束条件可以写成e T e=1。我们要求解的是一个带等式约束的极值问题,可以使用拉格朗日乘数法。构造拉格朗日函数:
因此,这个矩阵半正定。这里需要最大化 e T Se 的值,由于
因此, 为散度矩阵最大的特征值时, e T Se 有极大值,目标函数取得极小值。将上述结论从一维推广到 d' 维。每个向量可以表达成
在这里 e i 是单位向量。误差函数变成
可以证明,使得该函数取最小值的 e j 为散度矩阵最大的d'个特征值对应的单位长度特征向量,即求解下面的优化问题:
其中, tr 为矩阵的迹。矩阵W的列 e j 是要求解的迹的基向量。散度矩阵是实对称矩阵,属于不同特征值的特征向量相互正交。前面已经证明这个矩阵半正定,特征值非负。这些特征向量构成一组基向量,可以用它们的线性组合来表达向量 x 。从另外一个角度来看,这种变换将协方差矩阵对角化,相当于去除了各分量之间的相关性。
从上面的推导过程可以得到计算投影矩阵的流程如下:
(1)计算样本集的均值向量,将所有向量减去均值,这成为白化;
(2)计算样本集的协方差矩阵;
(3)对协方差矩阵进行特征值分解,得到所有特征值与特征向量;
(4)将特征值从大到小排序,保留最大的一部分特征值对应的特征向量,以它们为行,形成投影矩阵。
具体保留多少个特征值由投影后的向量维数决定。使用协方差矩阵和使用散度矩阵是等价的,因为后者是前者的 n 倍,而矩阵 A 和 nA 有相同的特征向量。
得到投影矩阵之后可以进行向量降维,将其投影到低维空间。向量投影的流程如下。
(1)将样本减掉均值向量。
(2)左乘投影矩阵,得到降维后的向量。
向量重构指根据投影后的向量重构原始向量,与向量投影的作用和过程相反。向量重构的流程如下。
(1)输入向量左乘投影矩阵的转置矩阵。
(2)加上均值向量,得到重构后的结果。
从上面的推导过程可以看到,在计算过程中没有使用样本标签值,因此,主成分分析是一种无监督学习算法。除了标准算法之外它还有多个变种,如稀疏主成分分析、核主成分分析、概率主分量分析等。
源码讲解视频链接
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