贝叶斯算法matlab
㈠ 贝叶斯的mcmc算法怎么在matlab里实现呀 或者gibbs抽样 求代码
MATLAB中只有矩阵和cell,如果是想要在matlab里实现
要取出第r行、第c列的矩阵元素用:A(r,c)
要取出第r行、第c列的cell成员用:A{r,c}
㈡ 贝叶斯mcmc的matlab程序怎么写
%By Shelley from NCUT,April 14th 2011
%Email:[email protected]
%此程序利用贝叶斯分类算法,首先对两类样本进行训练,
%进而可在屏幕上任意取点,程序可输出属于第一类,还是第二类
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
clear;
close all
%读入两类训练样本数据
load data
%求两类训练样本的均值和方差
u1=mean(Sample1);
u2=mean(Sample2);
sigm1=cov(Sample1);
sigm2=cov(Sample2);
%计算两个样本的密度函数并显示
x=-20:0.5:40;
y= -20:0.5:20;
[X,Y] = meshgrid(x,y);
F1 = mvnpdf([X(:),Y(:)],u1,sigm1);
F2 = mvnpdf([X(:),Y(:)],u2,sigm2);
P1=reshape(F1,size(X));
P2=reshape(F2,size(X));
figure(2)
surf(X,Y,P1)
hold on
surf(X,Y,P2)
shading interp
colorbar
title('条件概率密度函数曲线');
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
%以下为测试部分
%利用ginput随机选取屏幕上的点(可连续取10个点)
%程序可根据点的位置自动地显示出属于那个类
%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%%
pw1=0.4;pw2=0.6;
figure(1)
plot(Sample1(:,1),Sample1(:,2),'r.')
hold on
plot(Sample2(:,1),Sample2(:,2),'b.')
for i=1:10
[u,v]=ginput(1);
plot(u,v,'m*');
P1=pw1*mvnpdf([u,v],u1,sigm1);
P2=pw2*mvnpdf([u,v],u2,sigm2);
hold all
if(P1>P2)
disp('it belong to the first class');
else
disp('it belong to the second class');
end;
end
㈢ bnt matlab 怎么做mcmc有向无环贝叶斯网络结构学习
基于matlab的贝叶斯网络工具箱BNT是kevin p.murphy基于matlab语言开发的关于贝叶斯网络学习的开源包,提供了许多贝叶斯网络学习的底层基础函数库,支持多种类型的节点(概率分布)、精确推理和近似推理、参数学习及结构学习、静态模型和动态模型。
贝叶斯网络表示:BNT中使用矩阵方式表示贝叶斯网络,即若节点i到j有一条弧,则对应矩阵中(i,j)值为1,否则为0。
结构学习算法函数:BNT中提供了较为丰富的结构学习函数,都有:
学习树扩展贝叶斯网络结构的TANC算法learn_struct_tan().
2. 数据完整条件下学习一般贝叶斯网络结构的K2算法learn_struct_k2()、贪婪搜索GS(greedy search)算法learn_struct_gs()和爬山HC(hill climbing)算法learn_struct_hc()等。
3. 缺失数据条件下学习一般贝叶斯网络结构的最大期望EM(expectation maximization)算法learn_struct_EM()和马尔科夫链蒙特卡罗MCMC(Markov Chain Monte Carlo)learn_struct_mcmc()算法等。
参数学习算法函数:BNT中也提供了丰富的参数学习函数,都有:
1. 完整数据时,学习参数的方法主要有两种:最大似然估计learn_params()和贝叶斯方法bayes_update_params();
2. 数据缺失时,如果已知网络拓扑结构,用EM算法来计算参数,倘若未知网络拓扑结构,使用结构最大期望SEM(structure EM)算法learn_struct_SEM()。
推理机制及推理引擎:为了提高运算速度,使各种推理算法能够有效应用,BNT工具箱采用了引擎机制,不同的引擎根据不同的算法来完成模型转换、细化和求解。这个推理过程如下:
BNT中提供了多种推理引擎,都有:
1. 联合树推理引擎jtree_inf_engine();
2. 全局联合树推理引擎global_joint_inf_engine();
3. 信念传播推理引擎 belprop_inf_engine();
4. 变量消元推理引擎 var_elim_inf_engine().
㈣ 贝叶斯算法是什么
贝叶斯算法是统计学的一种分类方法,它是一类利用概率统计知识进行分类的算法。在许多场合,朴素贝叶斯(Naïve Bayes,NB)分类算法可以与决策树和神经网络分类算法相媲美,该算法能运用到大型数据库中,而且方法简单、分类准确率高、速度快。
由于贝叶斯定理假设一个属性值对给定类的影响独立于其它属性的值,而此假设在实际情况中经常是不成立的,因此其分类准确率可能会下降。为此,就衍生出许多降低独立性假设的贝叶斯分类算法,如TAN(tree augmented Bayes network)算法。
贝叶斯算法的主要步骤:
1、收集大量的垃圾邮件和非垃圾邮件,建立垃圾邮件集和非垃圾邮件集。
2、提取邮件主题和邮件体中的独立字符串,例如ABC32,¥234等作为TOKEN串并统计提取出的TOKEN串出现的次数即字频。按照上述的方法分别处理垃圾邮件集和非垃圾邮件集中的所有邮件。
3、每一个邮件集对应一个哈希表,hashtable_good对应非垃圾邮件集而hashtable_bad对应垃圾邮件集。表中存储TOKEN串到字频的映射关系。