mit数据库
‘壹’ 生物催化和生物降解的数据库及网址有哪些
一般来说所用的分析工具有在线跟下载的下面简要列举一些常用在线软件的使用1、使用VecScreen工具,分析下列未知序列,输出序列长度、载体序列的区域、可能使用的克隆载体都有哪些。一、步骤:
打开google首页,搜索VecScreen,进入VecScreen首页,复制序列,运行,Viewreport。
二、结果:
输出序列长度918bp,载体序列的区域456bp——854bp.
克隆载体:M13mp18phage,pGEM-13Zf(),pBR322,pRKW2。
2、使用相应工具,分析下列未者帆知序列的重复序列情况,输出重复序列的区域、包含的所有重复序列的类型、重复序列的总长度及MaskedSequence。
一、步骤:
进入google首页,进入ICBI主页,对序列进行BLAST。得出序列是human的。
进入google首页,搜索,进入主页,进入,复制序列,DNAsource选择human,运行!点击超链接,在结果中选择
AnnotationFile:_1287631711.out.html
3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具,分析下列未知序列,输出CpG岛的长度、区域、GC数量、所占首粗雹的百分比及Obs/Exp值。一、步骤:
进入google首页,搜索CpGPlot,进入CpGPlot主页,program中选择cpgreport复制序列,运行!
二、结果:
CpG岛的长度:385bp
区域:48——432;
GC数量:SumCG=297,百分数=77.14
Obs/Exp:1.01、4、预测下面序列的启动子,输出可能的启动子序列及相应的位置。一、步骤:
进入google首页,进入ICBI主页,对序列进行BLAST。凳耐得出序列是human的
进入google首页,搜索,进入主页,复制序列,选择eukaryote,运行!
二、结果:
位置:711—761,1388—1438,1755—1805;
5、运用SpliceSitePrediction工具分析下面序列,分别输出内含子-外显子剪接位点给体和受体的区域及剪接处位置的碱基。一、步骤:
进入google首页,进入ICBI主页,对序列进行BLAST。得出序列是human的
进入google首页,搜索SpliceSitePrediction,进入主页,复制序列。Organism选择Humanorother。其他默认,运行!
二、结果:
供体:
受体:
6、对下面序列进行六框翻译,利用GENESCAN综合分析(首先确定给定序列的物种来源)哪个ORF是正确的,输出六框翻译(抓图)和GENESCAN结果(包括predictedgenes/exons和predictedpeptidesequence(s)两个部分)。一、步骤:
进入google首页,进入ICBI主页,对序列进行BLAST。得出序列是Zea的
进入google首页;搜索NCBI,进入主页,选择allresources(A~Z),选择O,选择ORFfinder。复制序列,默认,运行!
二、结果:ORF图
三、步骤:进入google首页,搜索GENESCAN,进入主页,Organism:Maize,,其他默认,运行!
四、结果:
G7、进入REBASE限制性内切酶数据库,输出AluI、MboI、EcoI三种内酶的RecognitionSequence和Type。
一、步骤:进入google首页,googleinEnglish,搜索REBASE,进入主页,分别输入AluI、MboI、EcoI,运行!
在MboI中选择第一个,EcoI选择第二个。
二、结果:
ENSCAN图
8、使用引物设计工具,针对下列未知序列设计一对引物,要求引物长度为20-25bp,扩增产物长度300-500bp,退火温度为50-60℃。请写出选择的一对引物(ForwardPrimerandReversePrimer)、及相应的GC含量、引物的位点、Tm值和产物长度。一、步骤:进入google首页,搜索genefisher,进入主页,复制fasta格式,chechkinput,sunmit,;;设置一下引物长度为20-25bp,扩增产物长度300-500bp,退火温度为50-60℃;。
二、结果:
GC含量:
引物的位点:
Tm值:
产物长度:。
9、将下面的序列用NEBcutter2.0工具分析,用产生平末端及有四个酶切位点的酶进行酶切,并用抓图提交胶图(viewgel),要求1.4%agarose和Marker为100bpDNALadder。
一、步骤:
进入google首页,进入ICBI主页,对序列进行BLAST,得知是linear。
进入google首页,搜索NEBcutter2.0,进入主页,选择linear,运行!选择customdigest,,把“1”改为“4”,选择平末端,后digest。Viewgel。选择1.4%agarose和Marker为100bp。
二、结果:
然后就是蛋白质的了一般都在expasy里swiss-prot适用于检索的computepi/mw求理论分子量分子量protparam物理化学性质protscale亲水性疏水性peptidemass分析蛋白酶和化学试剂处理后的内切产物
NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)-GenBank数据库
数据库相似性搜索——核酸序列与核酸数据库比较(BLASTN)
蛋白质序列与数据库中蛋白质序列比较(BLASTP)
两序列比对(Aligntwosequences)
DNA序列分析——ORFFinder(www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)
分析实验序列外显子部分——GENSCAN(genes.mit.e/GENSCAN.html)
分析实验序列的可能酶切位点——NEBcutter2.0(tools.neb/NEBcutter2/index.php)
注:Customdigest--viewgel
限制性内切酶数据库——REBASE(rebase.neb/rebase/rebase.html)
设计引物扩增实验序列——Genefisher
Primer3
蛋白质序列分析及结构预测:
1.预测蛋白质的分子量及等电点:ExPASy(ComputepI/Mw)
2.分析蛋白质的基本物理化学性质:ExPASy(ProtParam)
3.分析蛋白质的亲水性和疏水性:ExPASy(ProtScale)
4.分析蛋白质在各种蛋白酶和各种化学试剂处理后的内切产物:ExPASy(PeptideMass)[*:kinaseK]
5.分析蛋白质的信号肽:ExPASy(SignalP)
6.预测蛋白质的二级结构:ExPASy(Jpred3)
多物种分子系统发育分析:EMBL(www.ebi.ac.uk/embl/)--Toolbox--Clustal2W
人脂联素蛋白质序列:NP_004788
人类胰岛素生长因子IB前体:P05019
‘贰’ 如何使用其它高校,如MIT、清华大学等,的 数据库 在线等,求高手指教.
曾经见多有本校学生在外面也可以使用本校的数据库的,估计是有与学校关联的软件才行。
‘叁’ MIT-BIH心电数据库里面有正常的心电信号吗
有;
MIT-BIH 是由美国麻省理工学院提供的研究心律失常的数据库。目前国际上公认的可作为标准的心电数据库有三个,分别是美国麻省理工学院提供的MIT-BIH 数据库,美国心脏学会的AHA数据库以及欧洲AT-T心电数据库。其中MIT-BIH 数据库近年来应用比较广泛。
MIT-BIH 的数据格式:
MIT-BIH 为了节省文件长度和存储空间,使用了自定义的格式。一个心电记录由三个部分组成:
(1)头文件[.hea],存储方式ASCII码字符。
(2)数据文件[.dat],按二进制存储,每三个字节存储两个数,一个数12bit。
(3)注释文件[.art],按二进制存储。
‘肆’ 数据库删除语句怎么写
问题一:删除数据库的sql语句如何写? drop database 数据库名 --删除数据库的
drop table 表名--删除表的
delete from 表名 where 条件 --删除数据的
truncate table 表名 也是删除数据库的.但是他可以裁断序列 这个你跟DELETE 对照试一下就知道了
问题二:数据库中如何用语句删除表中的列 各主流数据库用法如下:
sqlserver:
alter table 表名 drop column 列名;oracle:
alter table 表名 drop column 列名;mysql:
alter table 表名 drop column 列名;总结:在主流数据库下,删除列的语法是一致的,并无差别。
问题三:oracle数据库删除表中一条数据SQL语句 delete from 表名 where 条件
mit; 提交
问题四:SQL 删除语句怎么写呢? 其实我觉得你应该写成
delete from studentInfo where stuid = ‘2’试试,像你说的如果不是ID字段类型不是int,应该是不会出现这种情况的,你试试,不行再想别的办法
当然下面的语句也打上引号试试:
stmt.executeUpdate(delete from studentInfo where stuid = '攻+studentBean.getStuID()+' ) ;
试试吧,祝你好运!
问题五:sql 删除语句 5分 DELETE 语句
DELETE 语句用于删除表中的行。
语法
DELETE FROM 表名称 WHERE 列名称 = 值
删除某行
DELETE FROM 表名称 WHERE 列名称 = 值(删除条件)
删除所有行
可以在不删除表的情况下删除所有的行。这意味着表的结构、属性和索引都是完整的:
DELETE FROM 表名 或者:
DELETE * FROM 表吵团名
通过使用 DROP 语句,可以轻松地删除索引、表和数据库
DROP INDEX 索引名称
DROP TABLE 表名侍乱称
DROP DATABASE 数据库名称
不删除表,只删除表中的数据
TRUNCATE TABLE 表名称
问题六:这句 sql 删除语句怎么写 de唬ete from student where name='ABC';
delete from student where name in('ABC','AB','X','YXA');
问题七:oracle 删除sql语句怎么写 首先你要明确你要删什么东西
如果是删除一个表里面的数据,那你要明确是全表删除还是只删除某一部分数据
表删除语句: delete from 表名where 要删除的条件;
如果是全表删除可以这样写升谈橘:delete from 表名,或者直接裁剪表 truncate table 表名;
问题八:mysql中删除表中所有数据的sql语句怎么写 清空全部数据,不可恢复,速度快
truncate table 表名
清空全部数据,数据可恢复,速度慢delete from 表名
问题九:php删除sql数据库的语句 啥意思?sql语句我写不全,写个大概意思
Delete where iid='75839';
问题十:MYSQL的删除语句怎么写 用NOT IN
DELETE FROM A where UID not in (select UID from B)