微卫星数据库
㈠ 手机的ssr模式是什么哦
不懂哎 、这是在网上查的。、SSR在固体继电器中固体继电器( SSR) 是一种全部由电子元器件组成的新型无触点开关器件,具有高可靠性、长寿命、低噪音、开关速度快、抗干扰能力强、耐振动、耐冲击、防湿、防潮、防腐蚀、能与TTL 、CMOS 等逻辑电路兼容的优点,逐渐被越来越多的应用领域所接受。在电力无功补偿的控制领域中,对于免维护设备的操作要求,传统的交流接触器控制容性负载受到了巨大的挑战。虽然通用交流SSR 以其独特的过零导通的特点被广大用户所青睐,但是对于高电压高冲击电流的容性负载,通用交流SSR 难以满足控制要求,制约着SSR 在这一领域的推广应用。 SSR可分为交流和直流两种,是通过较低的电压(DC3V~32V)来触发晶闸管(单向或双向可控硅),使其负载端导通,输出较高的直流或交流,从而达到通过较低电压来控制较高电压或较强电流的目的。与普通的交流接触器相比,其在导通及截止时不会产生电火花现象。 编辑本段SSR在简单重复序列中 简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA) n和(TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段,由于核心序列串联重复数目不同,因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物,将扩增产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。在真核生物中,存在许多2-5bp简单重复序列,称为“微卫星DNA”其两端的序列高度保守,可设计双引物进行PCR扩增,揭示其多态性。 SSR具有以下一些优点:(l)一般检测到的是一个单一的多等位基因位点;(2)微卫星呈共显性遗传,故可鉴别杂合子和纯合子;(3)所需DNA量少。显然,在采用SSR技术分析微卫星DNA多态性时必须知道重复序列两端的DNA序列的信息。如不能直接从DNA数据库查寻则首先必须对其进行测序。 编辑本段SSR在系统服务代表中 SSR(System Services Representive ) Job description: The System Services Representive (SSR) is primarily responsible for the post sale maintenance of IBM hardware and software in customer account. The SSR performs services activities including stsems assurance, installation planning, account management, system problem determination, discontinuances, relocation, diagnosis etc. Job Requirement: 1. Teamwork, account management, situation handling 2. Communication Skill 3. Good at Writing and Oral English 4. AIX, Unix or Linux related Experiences is a good plus 5. Bachelor's Degree or above 编辑本段SSR在数理统计中 SSR(新复极差法) LSR(最小显着极差法) 方差分析结束后,固定模型下需要对存在显着差异的几组处理进行多重比较,常用的方法有最小显着差数法(LSD)和最小显着极差法(LSR)。其中最小显着差数法中只应用一个尺度LSDα对a(a-1)/2对数据进行多重比较,会使犯第一类错误的机会增大;最小显着极差法先将数据排序,根据位置差异采用不同的比较标准。 LSR法检验统计量计算有Duncan于1955年提出的新复极差法(SSR法)和Tukey于1949年提出的q法: SSR=(xi.-xj.)/SE~SSR(p,fe) q=(xi.-xj.)/SE~q(p,fe) SE=(MSe/r)开平方 词条图册更多图册 扩展阅读: 1 http://ke..com/view/660796.htm开放分类: 物理学,电学,分子生物学,生物技术,分子标记 “SSR”在英汉词典中的解释(来源:网络词典): SSR abbr. 1. =Soviet Socialist Republic 前苏维埃社会主义共和国
ssr abbr. 1. =secondary surveillance radar 辅助监视雷达
㈡ SSR分子标记的原理
简单重复序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 简单重复序(SSR)也称微卫星DNA,其串联重复的核心序列为1一6 bp,其中最常见是双核苷酸重复,即(CA) n和(TG) n每个微卫星DNA的核心序列结构相同,重复单位数目10一60个,其高度多态性主要来源于串联数目的不同。SSR标记的基本原理:根据微卫星序列两端互补序列设计引物,通过PCR反应扩增微卫星片段,由于核心序列串联重复数目不同,因而能够用PCR的方法扩增出不同长度的PCR产物,将扩增产物进行凝胶电泳,根据分离片段的大小决定基因型并计算等位基因频率。在真核生物中,存在许多2-5bp简单重复序列,称为“微卫星DNA”其两端的序列高度保守,可设计双引物进行PCR扩增,揭示其多态性。 SSR具有以下一些优点:(l)一般检测到的是一个单一的多等位基因位点;(2)微卫星呈共显性遗传,故可鉴别杂合子和纯合子;(3)所需DNA量少。显然,在采用SSR技术分析微卫星DNA多态性时必须知道重复序列两端的DNA序列的信息。如不能直接从DNA数据库查寻则首先必须对其进行测序。 SSR的分类 根据SSR核心序列排列方式的不同,可分为3种类型: 完全型(perfect)。指核心序列以不间断的重复方式首尾相连构成的DNA。如: 不完全型(imperfect)。指在SSR的核心序列之间有3个以下的非重复碱基,但两端的连续重复核心序列重复数大于3 。如: 复合型(compound) 。指2个或2个以上的串联核心序列由3个或3个以上的连续的非重复碱基分隔开,但这种连续性的核心序列重复数不少于5 。如: 3种类型中完全型是SSR标记中应用较多的一种类型。 SSR在植物基因组中的分布 SSR广泛分布于各种真核生物的基因组中,大约每隔10~50kb就存在一个SSR。哺乳动物中的SSR的数量大约为植物中的5~6倍。在植物中,平均23.3kb就有一个SSR;双子叶植物中的SSR数量大于单子叶植物,前者两个SSR之间的平均间距为21.2kb,后者为64.6kb;核DNA中的SSR数量多于细胞质DNA中的SSR,绝大多数单碱基重复型及2碱基重复型SSR存在于非编码区,3碱基重复型多位于编码区。 微卫星的利用价值 由于核心序列重复数的不同,等位的SSR位点可呈现出多态性(SSLP,simple sequence length polymorphism)。大多表现为共显性遗传,有的表现为显性遗传。由于SSR DNA两侧序列(离开20bp以上)表现出保守特征,所以可设计出上下游PCR引物,扩增出包含SSR的DNA序列。 微卫星分析常用于:遗传图谱构建;种质鉴定;遗传多样性分析;标记辅助选择(MAS,marker- assistant seletion,marker- aided seletion);基因定位;数量性状基因座(QTL)分析;系谱分析;亲源关系鉴定等。 SSR引物的来源 借鉴其他近缘种序列。 通过筛选文库、测序开发自己的SSR引物。 通过核酸数据库查询,从已有序列中搜寻包括SSR的序列并设计引物。 SSR分析实验的主要技术环节 提取DNA;PCR扩增;电泳及显色;电泳胶板带型的照相、记录;数据分析处理。 其中,PCR产物分离的电泳方法主要有:高浓度琼脂糖电泳(4%胶只能分辨4-6bp差异);变性聚丙烯酰胺序列胶电泳;非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳。 由于扩增的片段短(一般小于300bp),基因间的差异小(一般为几个bp),故通常使用分辨率高的聚丙烯酰胺凝胶电泳。在程序上,变性胶虽然比非变性胶麻烦些,但考虑到在非变性胶上会出现人为假象—异源双链分子,比如导致SSR杂合子中出现3-4条带,而不是正常的2条带,从而干扰等位位点统计,因此我们建议在SSR分析中均采用变性胶电泳。
㈢ Y-STR方法首次成功应用!它“神”在哪儿
近日,悬而未决的甘肃白银系列强奸杀人案件宣布成功告破,真兇高承勇这个系列杀人狂终于在逍遥法外28年之久后被捕归案。公安机关最后缉捕真兇的技术简称为Y-STR技术。帮助据信该技术是我国在破解疑难悬案方面的首次成功应用。那么这个技术到底“神”在哪儿?
何为Y-STR技术?
Y-STR的中文意思为Y-染色体DNA连续重复片段,是英文Y-ChromosomeShort Tandem Repeat的缩写。该技术就属性而言是一种人类个体遗传基因的检测和识别技术。要搞清楚它“神”在哪儿,首先要知道它具体是怎么一回事儿。这还得从什么是STR,即DNA连续重复片段说起。
STR(ShortTandem Repeat)就是大家可能听说过的DNA指纹。生物遗传基因在其DNA序列上存在两个或三个碱基连续多次重复的现象,简称为STR。大家知道我们人类的遗传基因DNA在化学上由脱氧核糖核酸组成,单个碱基通常被A、G、C或T这四个字母表示。实际上,地球所有生物的遗传基因在AGCT碱基构成层面是完全一样的,所不同的是每一个物种的碱基排列顺序不一样。开始于上世纪80年代的人类基因组计划的直接目标就是准确给出这些核苷碱基的排列顺序,人类基因组的序列已经准确测出,碱基总数30亿个左右,分布在23条染色体上。上世纪70年代科学家就发现,几乎所有高等生物的DNA序列中广泛分布着简单串联重复序列,如CACACA,或GACGACGAC,少则串联十几次,多则上百次。有趣的是这些串联重复序列(学术上也叫微卫星)的确切生物学功能至今未知,不少科学家至今仍在潜心研究并先后提出了多种假说。然而,科学家很快发现这些简单重复序列的重复次数在个体间变异幅度很大,甚至同一基因位点在同一家庭兄弟姐妹间就有差异,成为区分个体的重要遗传标志。这种碱基水平的差异可能与DNA在复制时这个区段容易出现滑动错误有关,变异程度相对最高。歪打正着,在实践中非常有用的DNA指纹技术从此诞生了。科学家后来发现,不仅人类,几乎全部高等动物和植物都有这类DNA序列重复。DNA指纹作为一种精确的基因位点识别技术现在被广泛应用于人类、动物、植物物种或品种标记或识别,在公安破案上已经被越来越多地应用。
而Y-STR则特指仅存在于人类男性体内Y-染色体DNA上的简单重复序列。人类除了有22对常染色体,还有一对决定性别的性染色体,即X染色体和Y染色体。男性的性染色体配对是XY型,女性是XX型。人类个体的性别在精子与卵子结合的那一刹那间被决定。受精时如果一个含Y染色体的精子攻入一个卵子,这个受精卵将会发育成男孩,反之一个X精子与一个卵母细胞结合则会是女孩。说到这里大家就知道了,原来Y-STR技术是一种专用于识别男性或雄性个体的DNA指纹技术。这项技术神就神在它能够以极其高的准确概率识别样本中(组织、细胞、血液、体液、头发、甚至指纹)的Y-STR重复状态,只要有对比资料,就能科学无误地判定二者是否为同一个体。
神奇之处:Y-STR在公安破案中可以大幅缩小破案范围至犯罪嫌疑人的父系家族
Y-STR神奇的地方就在于公安破案中可以大幅缩小破案范围至犯罪嫌疑人的父系家族。Y-染色体只传男性不传女性。同一父系家族的直系父子或旁系兄弟之间,Y-STR通常变化极小或没有变化,其变异率远远低于非同系男性之间,这就为依赖Y-STR分型锁定范围提供了科学依据。实际上,甘肃白银案就是靠犯罪嫌疑人堂兄因盗窃犯罪留下的Y-STR证据与上述白银案犯罪现场获得的同类证据资料对比而找到真兇的。因为在锁定的高姓嫌疑人中,唯有真兇高承勇有作案条件。在我们国家还没有建立起高覆盖率的DNA指纹库,特别是Y-STR库之前,这不能不说是神奇或幸运,具备一定的偶然性。
当然除了Y-STR技术,与之平行的还有人体指纹和相貌特征识别技术,包括人眼瞳孔识别技术也是非常有用的精确个体识别技术。这些技术除了公安破案,在其他如人员特定场所出入、保安、保密、资格认定、救援辨别等已经在开始实际应用,可以大大提高效率。这些技术的综合应用非常有助于提高公安案件侦破效率,有效弥补单一技术数据库容量不足的缺陷。可以设想,如果一个国家建立起一个全民覆盖的这类数据库,绝大多数需要个体识别的各类公安或非公安案件几乎可以在资料对比的瞬间得到科学答案。
编辑:纪阿黎
(专家:马润林,中国遗传学会专家、中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员、博士、博士生导师,文章来自科普中国头条创作与推送)
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㈣ 什么是基因组扫描
全基因组扫描
遗传分析仍是当前对致病相关基因识别、鉴定的主要方法,分为连锁分析和关联研究两种。由于人类基因组多态性的研究以及SNP分型技术的发展,目前全基因组连锁分析和关联研究亦变得切实可行。根据研究规模的大小,可以将疾病遗传分析分为以下几类,即定位克隆、连锁不平衡基因定位、全基因组候选基因分析、候选基因关联研究和定位候选基因克隆,其中定位克隆、连锁不平衡基因定位和全基因组候选基因分析均属于全基因组扫描。
不管是单基因疾病还是多基因疾病,通常是先行全基因组扫描(genome scanning);将疾病相关位点定位于染色体某个区域,然后再行候选基因策略或连锁不平衡分析,确定致病基因位点。如果利用家系进行连锁分析,即采用定位克隆;若是利用群体样本,则应用连锁不平衡分析进行基因定位。全基因组扫描已成功地应用在许多疾病的致病相关基因克隆上,并取得了一定的成果。
全基因组扫描所利用的是在人类基因组大量存在的微卫星或SNP,虽然当前使用较多的仍是微卫星,但由于芯片技术的发展,全基因组高分布密度的商品化SNP芯片相继面世(如Affymetrix公司的10k,100k和500k人基因组SNP芯片),越来越多的研究者使用SNP进行全基因组扫描。由于这些高密度的SNP芯片价格昂贵,不是一般的实验室所能承受。
微卫星全基因组扫描的原理是利用特定的引物将某条染色体上特定位置的微卫星扩增出来,并进行分析。这种分析所使用的微卫星通常具有较高的多态性,在不同的个体其长度不尽相同(也就是微卫星基本单位重复次数的不同),而不同长度的PCR产物则代表某一位点不同的等位基因。该种分析方法实际上是利用平均分布于各条染色体上的密度约为10cM的微卫星,检测每个微卫星是否存在与其邻近的疾病相关基因座位连锁。全基因组扫描并不能直接搜寻具体的疾病相关基因,而是通过研究均匀分布于整个基因组的微卫星标记来间接选择其相关的基因座位。在得到阳性结果后,又可在这些阳性位点附近再加密微卫星标记或利用SNP,用同样的方法来确定哪一个多态性位点与疾病连锁的可能性最大等等。这样在不断地缩小分析范围后,疾病相关基因定位的范围也越来越精细。由于人类基因组序列已知,一旦发现了与疾病相关基因连锁两侧的遗传标记,根据标记位点的具体位置,我们就可以知道定位区域内所有的基因。因此,当定位区域确定后,在该区域内选择候选基因直接进行测序,对所发现的突变在病人和对照组进行分型并分析,搜寻致病基因。另一个方法是直接从公共数据库挑选候选基因编码区、调控区(包括内含子)中的SNP,进行连锁不平衡分析,确定致病基因。
虽然单个SNP的多态信息量(polymorphism information content,PIC)不如微卫星,但在相同的PIC值的要求下,SNP图谱的密度为微卫星图谱的2.25—2.5倍。因此在相同的信息提取效果下,利用10cM间隔的微卫星图谱即300个左右的微卫星标记进行初期定位,与4cM分辨率的约750个SNP图谱差不多,显然后者对基因定位的范围更精细,因此利用SNP标记能检测出微卫星标记不能探测到的疾病相关区域。随着人类基因组的重测序和DNA芯片技术的不断完善,目前已有应用于全基因组扫描的SNP芯片,如Affymetrix公司的GeneChip Mapping 500K ArraySet、100kArraySet和10k的SNP芯片(SNP数目分别约为50万、10万和1万)。显然这些芯片的SNP分布密度以及信息度大大高于定位克隆常规使用的微卫星,并已成功应用于疾病相关基因的研究。预计随着SNP芯片的进一步完善和成本的降低,将是未来疾病相关基因研究的主流技术。
全基因组扫描用的成套微卫星引物,可多达上千个。引物的5’末端标记在激光激发下可发出不同颜色光的荧光素标记,如此可进行多重PCR,加速实验的进程。每一样本的PCR产物长度大小可以通过ABI或MegaBACE等测序仪进行检测。通过收集每一个个体的相关信息,经软件分析后即可得到结果。而采用Affymetrix公司的全基因组高密度的SNP芯片,操作更为简单。每个个体的DNA经酶切、PCR扩增、荧光标记、杂交扫描后即可得到每个个体上万个SNP的具体信息,经遗传分析后就可得到定位结果,且定位的区域一般比微卫星定位的小很多。
㈤ 如何根据微卫星引物在NCBI里面找到该位点的登记号或序列
现在NCBI中BLAST引物(注意选择BLAST的数据库),然后再Blast结果中找寻符合要求的序列。后面会列出很多链接,直接就能看到NCBI号
进入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
在最上面的最大的空格里填上你要搜索的序列,如peimerA:“TCCCCAGCTGGAAGATGTGTCACG”(只填序列)在Database选择数据库,然后点最下面的BLAST按钮。
结果中最符合的列在前面,一般就是想要的。
你做得是罗非鱼?NCBI号是AF033802
㈥ 什么是全基因组扫描其用途是什么
遗传分析仍是当前对致病相关基因识别、鉴定的主要方法,分为连锁分析和关联研究两种。由于人类基因组多态性的研究以及SNP分型技术的发展,目前全基因组连锁分析和关联研究亦变得切实可行。根据研究规模的大小,可以将疾病遗传分析分为以下几类,即定位克隆、连锁不平衡基因定位、全基因组候选基因分析、候选基因关联研究和定位候选基因克隆,其中定位克隆、连锁不平衡基因定位和全基因组候选基因分析均属于全基因组扫描。
不管是单基因疾病还是多基因疾病,通常是先行全基因组扫描(genome scanning);将疾病相关位点定位于染色体某个区域,然后再行候选基因策略或连锁不平衡分析,确定致病基因位点。如果利用家系进行连锁分析,即采用定位克隆;若是利用群体样本,则应用连锁不平衡分析进行基因定位。全基因组扫描已成功地应用在许多疾病的致病相关基因克隆上,并取得了一定的成果。
全基因组扫描所利用的是在人类基因组大量存在的微卫星或SNP,虽然当前使用较多的仍是微卫星,但由于芯片技术的发展,全基因组高分布密度的商品化SNP芯片相继面世(如Affymetrix公司的10k,100k和500k人基因组SNP芯片),越来越多的研究者使用SNP进行全基因组扫描。由于这些高密度的SNP芯片价格昂贵,不是一般的实验室所能承受。
微卫星全基因组扫描的原理是利用特定的引物将某条染色体上特定位置的微卫星扩增出来,并进行分析。这种分析所使用的微卫星通常具有较高的多态性,在不同的个体其长度不尽相同(也就是微卫星基本单位重复次数的不同),而不同长度的PCR产物则代表某一位点不同的等位基因。该种分析方法实际上是利用平均分布于各条染色体上的密度约为10cM的微卫星,检测每个微卫星是否存在与其邻近的疾病相关基因座位连锁。全基因组扫描并不能直接搜寻具体的疾病相关基因,而是通过研究均匀分布于整个基因组的微卫星标记来间接选择其相关的基因座位。在得到阳性结果后,又可在这些阳性位点附近再加密微卫星标记或利用SNP,用同样的方法来确定哪一个多态性位点与疾病连锁的可能性最大等等。这样在不断地缩小分析范围后,疾病相关基因定位的范围也越来越精细。由于人类基因组序列已知,一旦发现了与疾病相关基因连锁两侧的遗传标记,根据标记位点的具体位置,我们就可以知道定位区域内所有的基因。因此,当定位区域确定后,在该区域内选择候选基因直接进行测序,对所发现的突变在病人和对照组进行分型并分析,搜寻致病基因。另一个方法是直接从公共数据库挑选候选基因编码区、调控区(包括内含子)中的SNP,进行连锁不平衡分析,确定致病基因。
㈦ 国内已上市的PD-1PD-L1药物有哪些
通过数据库中的“中国药品批文数据库”查询了解,国内已上市的PD-1/PD-L1药物共有10种,其中包含2款进口PD-1和2款进口的PD-L1,6款国产PD-1/PD-L1药物。
国内已上市的PD-1/PD-L1药物包含
君实生物:特瑞普利单抗注射液
阿斯利康:度伐利尤单抗注射液
BMS:纳武利尤单抗注射液
信达生物:信迪利单抗注射液
默沙东:帕博利珠单抗注射液
百济神州:替雷利珠单抗注射液
苏州盛迪亚生物:注射用卡瑞利珠单抗
正大天晴/康方生物:派安普利单抗注射液
广州誉衡生物/药明生物:赛帕利单抗注射液
罗氏:阿替利珠单抗注射液
在数据库的“全球药物研发数据库”中能了解药物这些药物的研发进展,研发阶段、药物类型、治疗领域、化学数据等等,掌握PD-1/PD-L1药物研发进展了解全球新药研发趋势;解决立项、评估等问题;制定企业的战略规划。
PD-1/L1药物
以上就是国内已上市的PD-1/PD-L1药物,PD-1(程序性死亡受体1),也称为CD279(分化簇279),是一种重要的免疫抑制分子。通过向下调节免疫系统对人体细胞的反应,以及通过抑制T细胞炎症活动来调节免疫系统并促进自身耐受。这可以预防自身免疫性疾病,但它也可以防止免疫系统杀死癌细胞。