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smx算法

发布时间: 2022-07-25 21:57:26

㈠ 计算机辅助药物分子设计的目录

第一章药物研究及计算机辅助药物分子设计1
第一节 药物研究和开发的历史及现状1
第二节现代药物研究的四大技术支柱3
一、分子生物学、基因组学及蛋白质组学3
二、组合化学5
三、高通量筛选6
四、与药物研究相关的信息科学及技术7
第三节计算机辅助药物分子设计11
一、概述11
二、CADD方法的分类12
第二章计算化学中的最优化方法17
第一节 引论17
一、 最优化问题概述17
二、 数学预备知识18
三、最优化条件26
第二节数值最优化方法30
一、最优化算法的基本结构30
二、无约束问题的最优化方法33
第三章计算化学中的非数值最优化方法54
第一节引论54
一、计算复杂性54
二、局部搜索算法56
三、组合优化问题算法设计的思路58
第二节模拟退火63
第三节遗传算法77
第四节神经网络94
一、人工神经网络基本模型简介94
二、用于优化计算的网络模型连续型Hopfield网络96
三、自组织网100
第四章分子力场和力场参数化106
第一节分子力场的势函数形式108
第二节分子力场的分类115
一、 传统力场115
二、第二代力场118
三、 通用力场120
四、其他力场121
第三节力场参数的拟合121
第五章构象分析方法139
第一节小分子的构象分析方法139
一、系统搜索方法139
二、片段连接方法142
三、随机搜索方法143
四、距离几何方法143
五、分子动力学方法146
六、基于遗传算法的构象分析方法148
第二节蛋白质结构的预测149
第六章分子动力学164
第一节积分方法165
第二节初始化167
第三节粒子受力的求算 169
第四节边界条件173
第五节非键相互作用能的处理175
一、截断值方法175
二、FMM方法177
三、Barnes?Huts算法180
四、周期性边界条件方法181
第六节约束条件动力学186
第七节恒温和恒压分子动力学188
第八节分子动力学轨迹分析189
第七章溶剂效应197
第一节显示溶剂模型198
第二节连续介质模型199
一、表面加和模型199
二、泊松?玻耳兹曼模型202
三、GB/SA模型208
四、模型多级矩展开方法213
五、极化的连续介质模型213
六、SMx系列溶剂化模型215
第八章结合自由能计算218
第一节 引言218
一、 熵增加原理和Gibbs自由能218
二、受体?配体结合的亲和力220
三、自由能计算方法的分类223
第二节自由能微扰和热力学积分方法223
三、FEP和TI在药物设计中的应用227
第三节基于主方程的自由能计算方法229
一、MM/PBSA方法的原理229
二、MM/PBSA方法的应用230
三、MM/PBSA方法的发展和完善232
第四节基于经验方程的自由能预测234
一、B?hm的自由能预测模型234
二、Eldredge的自由能预测模型235
三、Head的自由能预测模型236
第五节LIE方法237
第九章定量构效关系方法研究246
第一节 二维定量构效关系方法246
一、Hansch法246
二、Free?Wilson法250
三、各种参数250
第二节建立定量构效关系模型的统计方法263
一、回归分析263
二、遗传算法265
三、人工神经网络267
第三节三维定量构效关系方法268
一、距离几何3D?QSAR268
二、分子形状分析270
三、比较分子场分析方法272
四、虚拟受体方法277
第四节QSAR的应用281
一、2D?QSAR的应用281
二、3D?QSAR的应用287
参考文献289
第十章 药效团模型方法295
第一节药效团模型的表达296
一、药效特征元素296
二、几何约束299
第二节药效团模型的识别300
一、药效团识别的基本步骤301
二、分子叠合和活性构象301
第三节基于药效团模型的数据库搜索303
一、基于药效团的数据库搜索303
二、柔性构象搜索304
第四节药效团识别系统305
一、Receptor305
二、Apex?3D306
三、DISCO307
四、GASP308
五、CATALYST309
六、几种药效团识别系统的性能比较311
第五节药效团模型方法的应用314
一、Muscarinic M3受体拮抗剂的设计315
二、5?HT3受体拮抗剂的设计317
三、MC增生抑制剂的设计318
四、PKC抑制剂的设计319
五、HIV?1整合酶抑制剂的设计320
第十一章分子对接方法325
第一节分子对接的原理325
一、分子对接的理论基础325
二、分子对接方法的分类326
三、分子对接方法中的重要问题326
第二节几种有代表性的分子对接方法327
一、DOCK328
二、AUTODOCK332
三、FlexX335
四、Affinity337
五、LigandFit340
六、SFDOCK341
第三节虚拟筛选的策略343
第四节分子对接在药物设计中的应用345
一、胸苷酸合成酶抑制剂的设计348
二、DHFR抑制剂的设计349
三、EGFR和抑制剂间相互作用模式的研究349
第十二章从头设计方法354
第一节从头设计方法的分类354
一、片段定位法355
二、位点连接法356
三、片段连接法357
四、逐步生长法360
第二节几种重要的从头设计方法362
一、GRID362
二、MCSS363
三、HINT365
四、LUDI366
五、Leapfrog369
第三节从头设计在药物开发中的应用371
一、fⅩa抑制剂的设计372
二、全新FKBP?12配体的设计373
第十三章分子三维结构数据库和虚拟组合化学377
第一节三维结构数据库378
一、剑桥结构数据库379
二、国家癌症研究所380
三、Available Chemicals Directory 3D(ACD?3D)380
四、Available Chemicals Directory?Screening(ACD?SC)381
五、MDL Drug Data Report 3D(MDDR?3D)381
六、Comprehensive Medicinal Chemistry(CMC)381
七、类似物设计的结构数据库BIOSTER382
八、Chapman & Hall Dictionary of Natural Proct(DNP)382
九、Metabolite382
十、Toxicity382
十一、中草药三维结构数据库383
第二节分子结构的拓扑表达和结构转化385
一、分子结构的拓扑表达386
二、分子三维结构的转化387
第三节数据库搜索技术388
一、子结构匹配388
二、相似性搜索392
第四节重要的三维结构搜索系统395
一、MDL/Base395
二、Unity396
第五节计算组合化学方法396
第十四章药代动力学特征和毒性的预测405
第一节药代动力学特征的预测406
一、脂水分配系数406
二、脑血分配系数414
三、肠通透性420
四、水溶性422
第二节分子毒性的预测425
一、引论425
二、计算机辅助的化合物毒性预测方法427
三、常见化合物毒性预测软件436
第十五章EGF?R和抑制剂间相互作用模式的研究447
第一节酪氨酸蛋白激酶447
一、PTK的结构特征447
二、EGF?R的结构特征448
三、EGF?R抑制剂的分类450
第二节苯胺喹唑啉类抑制剂的三维构效关系454
第三节EGF?R和喹唑啉类抑制剂结合模式的预测466
第十六章HIV?1蛋白酶抑制剂的设计476
第一节HIV?1病毒的结构和侵袭靶细胞的机制476
第二节基于HIV蛋白酶的抑制剂设计480
附录一分子模拟方法中常用概念和名词495
一、分子坐标表示495
二、分子表面498
三、分子图形显示模型500
四、量化计算常见术语简介502
附录二药物分子设计中常用软件列表505
1?大型分子模拟软件系统505
2?小型分子模拟软件系统507
3?小型药物设计软件系统508
4?常用量化计算软件509
5?分子力学、分子动力学和蒙特卡罗模拟软件510
6?QSAR和分子参数计算软件513
7?药效团模拟软件518
8?分子对接软件519
9?从头设计方法522
10?分子相似性和差异性分析以及组合库设计524
11?药代动力学和毒性预测软件526
12?蛋白质三维结构模建、结构评估和活性位点预测软件529
13?数据库搜索软件532
14?分子叠合532
15?二维转三维和文件格式转换软件533
16?分子显示软件534
17?求解PB方程的软件536
18?化学软件开发包536
19?国内主要软件代理商的相关信息537

㈡ 银河麒麟V10交换分区是什么意思

银河麒麟高级服务器操作系统V10是针对企业级关键业务,适应虚拟化、云计算、大数据、工业互联网时代对主机系统可靠性、安全性、性能、扩展性和实时性的需求,依据CMMI 5级标准研制的提供内生安全、云原生支持、国产平台深入优化、高性能、易管理的新一代自主服务器操作系统;同源支持飞腾、龙芯、申威、兆芯、海光、鲲鹏等自主CPU及x86平台;可支撑构建大型数据中心服务器高可用集群、负载均衡集群、分布式集群文件系统、虚拟化应用和容器云平台等,可部署在物理服务器和虚拟化环境、私有云、公有云和混合云环境;应用于政府、国防、金融、教育、财税、公安、审计、交通、医疗、制造等领域。

同源优化支持自主CPU

同源构建支持六大国产平台,内核、核心库和桌面环境等所有组件基于同一套源代码构建,并面向各自主CPU及服务器整机进行了针对性优化适配,为不同平台的软硬件生态提供兼容一致的开发和运行接口,为管理员提供一致的运维管理体验。

一体化内生本质安全

基于自主软硬件、密码技术的内核与应用一体化的内生本质安全体系:自研内核安全执行控制机制KYSEC、生物识别管理框架和安全管理工具,支持多策略融合的强制访问控制机制;支持国密算法SMx和可信计算TCM/TPCM、TPM2.0等;达到GB/T 20272第四级、B+级安全技术要求。

虚拟化及云原生支持,优化支持KVM、Docker、LXC虚拟化,以及Ceph、GlusterFS、OpenStack、k8s等原生技术生态,实现对容器、虚拟化、云平台、大数据等云原生应用的良好支持。

高可用性,通过XFS文件系统、备份恢复、网卡绑定、硬件冗余等技术和配套磁盘心跳级高可用集群软件,实现主机系统和业务应用的高可用保护。国产平台深入优化支持,针对不同自主CPU平台在内核安全、RAS特性、IO性能、虚拟化和国产硬件(桥片、网卡、显卡、AI卡、加速卡等)及驱动支持等方面优化增强,以及工控机支持。

可管理性,提供图形化管理工具和统一的综合管理平台(SystemCenter),实现对物理服务器集群运行状态的监控及预警、对虚拟化集群的配置及管控、对高可用集群的策略定制和资源调配等功

㈢ 银河麒麟操作系统V10的特点是什么

中国电子近日发布银河麒麟操作系统V10,该系统充分适应5G时代需求,打通了手机、平板电脑、PC等,实现多端融合。麒麟操作系统独创的kydroid技术,可以原生支持海量安卓应用,将300万余款安卓适配软硬件无缝迁移到国产平台上来。

银河麒麟操作系统并非“横空出世”。在此之前,银河麒麟操作系统已经连续9年位列中国Linux市场占有率第一名,在嫦娥探月、国家电网、北京地铁、航空公司客票系统中都发挥了重要作用。目前,已有1千家以上国内外主流生态企业在麒麟操作系统V10上完成了超过1万款的软硬件产品适配。

(3)smx算法扩展阅读

银河麒麟V10的发布受广泛关注的原因

1、近期美国挑衅不断,中国企业面临操作系统或遭禁令扼喉的威胁,自主操作系统的重要性因此陡然提升。

2、银河麒麟操作系统虽然已经研发了几十年,开始商用也已十几年,但主要应用在服务器端。而最新发布的银河麒麟操作系统V10,却有面向5G时代、面向个人终端、面向多端融合的强烈技术色彩,正好可以弥补自主操作系统的短板。

㈣ 基于Cortex-M33的LPC55xx系列支持SMX算法吗

LPC55是没有SMX算法的完整硬件支持的。

㈤ ANSYS应力图各字母什么意思

Nodal Solution 表示你的应力云图是基于节点的解进行插值绘出的
Sub=1表示第一个求解子步
Time=1表示第一个时间步,通常单位是秒
SEQV (AVG)表示等效应力的节点解的临近单元应力磨平算法的泛函解,等效应力又称冯米塞斯应力
DMX表示最大位移解
SMN表示最小应力解
SMX表示最大应力解
SMXB忘了。。。。不好意思这个我用的少

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