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kmedoids算法

发布时间: 2022-07-05 21:52:12

① k-medoids算法对大规模数据性能更好,但伸缩性较差是什么含义

这个问题其实是无解的,数据不同,算法的分类效果、实际运行时间也是不同。若单从运算速度而言,k-means比层次更快。原因是K-means是找中心,然后计算距离;层次是逐个样本逐层合并,层次的算法复杂度更高。更重要的是,在大数量下,K-means算法和层次聚类算法的分类效果真的只能用见仁见智来形容了。

② 聚类算法有哪些

聚类算法有:划分法、层次法、密度算法、图论聚类法、网格算法、模型算法。

1、划分法

划分法(partitioning methods),给定一个有N个元组或者纪录的数据集,分裂法将构造K个分组,每一个分组就代表一个聚类,K<N。使用这个基本思想的算法有:K-MEANS算法、K-MEDOIDS算法、CLARANS算法。

2、层次法

层次法(hierarchical methods),这种方法对给定的数据集进行层次似的分解,直到某种条件满足为止。具体又可分为“自底向上”和“自顶向下”两种方案。代表算法有:BIRCH算法、CURE算法、CHAMELEON算法等。

3、密度算法

基于密度的方法(density-based methods),基于密度的方法与其它方法的一个根本区别是:它不是基于各种各样的距离的,而是基于密度的。这样就能克服基于距离的算法只能发现“类圆形”的聚类的缺点。代表算法有:DBSCAN算法、OPTICS算法、DENCLUE算法等。

4、图论聚类法

图论聚类方法解决的第一步是建立与问题相适应的图,图的节点对应于被分析数据的最小单元,图的边(或弧)对应于最小处理单元数据之间的相似性度量。因此,每一个最小处理单元数据之间都会有一个度量表达,这就确保了数据的局部特性比较易于处理。图论聚类法是以样本数据的局域连接特征作为聚类的主要信息源,因而其主要优点是易于处理局部数据的特性。

5、网格算法

基于网格的方法(grid-based methods),这种方法首先将数据空间划分成为有限个单元(cell)的网格结构,所有的处理都是以单个的单元为对象的。代表算法有:STING算法、CLIQUE算法、WAVE-CLUSTER算法。

6、模型算法

基于模型的方法(model-based methods),基于模型的方法给每一个聚类假定一个模型,然后去寻找能够很好的满足这个模型的数据集。通常有两种尝试方向:统计的方案和神经网络的方案。

(2)kmedoids算法扩展阅读:

聚类分析起源于分类学,在古老的分类学中,人们主要依靠经验和专业知识来实现分类,很少利用数学工具进行定量的分类。随着人类科学技术的发展,对分类的要求越来越高,以致有时仅凭经验和专业知识难以确切地进行分类,于是人们逐渐地把数学工具引用到了分类学中,形成了数值分类学,之后又将多元分析的技术引入到数值分类学形成了聚类分析。聚类分析内容非常丰富,有系统聚类法、有序样品聚类法、动态聚类法、模糊聚类法、图论聚类法、聚类预报法等。

在商业上,聚类可以帮助市场分析人员从消费者数据库中区分出不同的消费群体来,并且概括出每一类消费者的消费模式或者说习惯。它作为数据挖掘中的一个模块,可以作为一个单独的工具以发现数据库中分布的一些深层的信息,并且概括出每一类的特点,或者把注意力放在某一个特定的类上以作进一步的分析;并且,聚类分析也可以作为数据挖掘算法中其他分析算法的一个预处理步骤。

③ kmedoids函数在哪个matlab里

我把K-mediods的matlab代码贴出来,你好好学习一下functionlabel=kmedoids(data,k,start_data)%kmedoidsk中心点算法函数%data待聚类的数据集,每一行是一个样本数据点%k聚类个数%start_data聚类初始中心值,每一行为一个中心点

④ k-means和gmm在求解聚类问题中的异同

Clustering Algorithms分类
1. Partitioning approach:
建立数据的不同分割,然后用相同标准评价聚类结果。(比如最小化平方误差和)
典型算法:K-Means, K-Medoids
2. Model-based:
对于每个类假定一个分布模型,试图找到每个类最好的模型
典型算法:GMM(混合高斯)
3. Dimensionality Rection Approach:
先降维,再聚类
典型算法:Spectral clustering,Ncut

⑤ 聚类算法的具体方法

k-means 算法接受输入量 k ;然后将n个数据对象划分为 k个聚类以便使得所获得的聚类满足:同一聚类中的对象相似度较高;而不同聚类中的对象相似度较小。聚类相似度是利用各聚类中对象的均值所获得一个“中心对象”(引力中心)来进行计算的。
k-means 算法的工作过程说明如下:
首先从n个数据对象任意选择 k 个对象作为初始聚类中心;而对于所剩下其它对象,则根据它们与这些聚类中心的相似度(距离),分别将它们分配给与其最相似的(聚类中心所代表的)聚类;
然后再计算每个所获新聚类的聚类中心(该聚类中所有对象的均值);不断重复这一过程直到标准测度函数开始收敛为止。
一般都采用均方差作为标准测度函数. k个聚类具有以下特点:各聚类本身尽可能的紧凑,而各聚类之间尽可能的分开。 K-MEANS有其缺点:产生类的大小相差不会很大,对于脏数据很敏感。
改进的算法:k—medoids 方法。这儿选取一个对象叫做mediod来代替上面的中心的作用,这样的一个medoid就标识了这个类。K-medoids和K-means不一样的地方在于中心点的选取,在K-means中,我们将中心点取为当前cluster中所有数据点的平均值,在 K-medoids算法中,我们将从当前cluster 中选取这样一个点——它到其他所有(当前cluster中的)点的距离之和最小——作为中心点。
步骤:
1,任意选取K个对象作为medoids(O1,O2,…Oi…Ok)。
以下是循环的:
2,将余下的对象分到各个类中去(根据与medoid最相近的原则);
3,对于每个类(Oi)中,顺序选取一个Or,计算用Or代替Oi后的消耗—E(Or)。选择E最小的那个Or来代替Oi。这样K个medoids就改变了,下面就再转到2。
4,这样循环直到K个medoids固定下来。
这种算法对于脏数据和异常数据不敏感,但计算量显然要比K均值要大,一般只适合小数据量。 上面提到K-medoids算法不适合于大数据量的计算。Clara算法,这是一种基于采样的方法,它能够处理大量的数据。
Clara算法的思想就是用实际数据的抽样来代替整个数据,然后再在这些抽样的数据上利用K-medoids算法得到最佳的medoids。Clara算法从实际数据中抽取多个采样,在每个采样上都用K-medoids算法得到相应的(O1, O2 … Oi … Ok),然后在这当中选取E最小的一个作为最终的结果。 Clara算法的效率取决于采样的大小,一般不太可能得到最佳的结果。
在Clara算法的基础上,又提出了Clarans的算法,与Clara算法不同的是:在Clara算法寻找最佳的medoids的过程中,采样都是不变的。而Clarans算法在每一次循环的过程中所采用的采样都是不一样的。
与上面所讲的寻找最佳medoids的过程不同的是,必须人为地来限定循环的次数。

⑥ 我用C++编了一个K-MEDOIDS算法,有些问题,求大神帮忙看看~

#include <iostream>
#include <stdio.h>
#include <time.h>
using namespace std;
int a[100]={0};
int n=10;
int i=0,k=0;
int flag=0;
int juli(int a,int b)
{
return (a-b)*(a-b);
}
int paixu(int *a)
{
int i1=0;
int jh=0;
int m=0;
for(i1=0;i1<10;i1++)
{ if(a[i1]<a[i1+1] )
{ jh=a[i1];
a[i1]=a[i1+1];
a[i1+1]=jh;
}
else
m=i1+1;
}
return m;//返回数组a中后项小于等于前项的个数
}

int paixu2(int *a)
{
int i1=0;
int jh=0;
int m=0;
for(i1=0;i1<100;i1++)
{ if(a[i1]<a[i1+1] )
{ jh=a[i1];
a[i1]=a[i1+1];
a[i1+1]=jh;
}
else
m=i1+1;
}
return m;
//返回后项小于等于前项的个数
}

void ql(int a[10][100])
{
int i,j;
for(i=0;i<10;i++)
for(j=0;a[i][j]!='\0';j++)
a[i][j]=0;
//为数组a整体赋值为0
}

void zxjuli( int a[10][100],int *b)
{
int i2=0,j2=0,k2=0,l2;
int e[100];

for(i2=0;i2<10;i2++)
{

for(l2=0;e[l2]!='\0';l2++)
e[l2]=0;//为数组e整体赋值为0

for(j2=0;a[i2][j2]!='\0';j2++)
{}//无意义的语句或者说是空语句

for(k2=0;a[i2][k2]!='\0';k2++ )
{
if(k2!=j2)//j2在上个for循环中的值有效作用域仅限于上个for循环的一对{}中
e[j2]+=juli(a[i2][j2],a[i2][k2]);
else
continue;
}
flag=paixu2(e);
b[i2]=a[i2][flag];
}
}

int b[10]={0};

int c[10][100]={0};
int j=0;
int d[10]={0};
int ax[100];
int main()
{
srand((unsigned)time(NULL));

int ix[10]={0};
for(i=0;i<10;i++)
ix[i]=1;

for( i=0;i<100;i++)

{ a[i]= 1+rand()%99;
ax[i]=a[i];
}
for(i=0;i<100;i++)
cout<<a[i]<<" ";
cout<<endl;
int t=0;

for(i=0;i<10;i++)
{
t=1+rand()%99; //随机选出10个中心
b[i]=a[t];
a[t]=-1;
}
for(i=0;i<10;i++)
c[i][0]=b[i];
for(i=0;i<100;i++)
if(a[i]!=-1)
{ for(k=0;k<10;k++)

{
d[i]=juli(a[i],b[k]);
flag=paixu(d);

}
c[flag][ix[flag]++]=a[i];
}

int ay[90];

for(j=0;j<100;j++)
{

for(i=0;i<10;i++)
ix[i]=1;
zxjuli(c,b);
int t=0;
for(i=0;i<100;i++)
{ for(k=0;k<10;k++)
{ if(ax[i]!=b[k])
flag=1;
else
{flag=0;
break;
}
}
if(flag==1)
ay[t++]=ax[i];
}

ql(c);
c[i][0]=b[i];
for(i=0;i<90;i++)
for(k=0;k<10;k++)

{ d[i]=juli(ay[i],b[k]);
flag=paixu(d);
c[flag][ix[flag]++]=a[i];
}

}
for(i=0;i<10;i++)
for(j=0;c[i][j]!='\0';j++)
cout<<i<<":"<<" "<<c[i][j]<<" ";
cout<<endl;

return 0;
}编写程序应该见名知意,力求同样功能的代码最简洁。你看看自己写的程序 for循环就不停的在嵌套 写的那么乱 编译虽然没问题仍然有几个bug,非正常中止。再好好改改吧 分数你爱给便给

⑦ 有哪些常用的聚类算法

聚类分析计算方法主要有如下几种:
1. 划分法(partitioning methods)
给定一个有N个元组或者纪录的数据集,分裂法将构造K个分组,每一个分组就代表一个聚类,K<N。而且这K个分组满足下列条件:(1) 每一个分组至少包含一个数据纪录;(2)每一个数据纪录属于且仅属于一个分组(注意:这个要求在某些模糊聚类算法中可以放宽);对于给定的K,算法首先给出一个初始的分组方法,以后通过反复迭代的方法改变分组,使得每一次改进之后的分组方案都较前一次好,而所谓好的标准就是:同一分组中的记录越近越好,而不同分组中的纪录越远越好。使用这个基本思想的算法有:K-MEANS算法、K-MEDOIDS算法、CLARANS算法;
2. 层次法(hierarchical methods)
这种方法对给定的数据集进行层次似的分解,直到某种条件满足为止。具体又可分为“自底向上”和“自顶向下”两种方案。例如在“自底向上”方案中,初始时每一个数据纪录都组成一个单独的组,在接下来的迭代中,它把那些相互邻近的组合并成一个组,直到所有的记录组成一个分组或者某个条件满足为止。代表算法有:BIRCH算法、CURE算法、CHAMELEON算法等;
3. 基于密度的方法(density-based methods)
基于密度的方法与其它方法的一个根本区别是:它不是基于各种各样的距离的,而是基于密度的。这样就能克服基于距离的算法只能发现“类圆形”的聚类的缺点。这个方法的指导思想就是,只要一个区域中的点的密度大过某个阀值,就把它加到与之相近的聚类中去。代表算法有:DBSCAN算法、OPTICS算法、DENCLUE算法等;
4. 基于网格的方法(grid-based methods)
这种方法首先将数据空间划分成为有限个单元(cell)的网格结构,所有的处理都是以单个的单元为对象的。这么处理的一个突出的优点就是处理速度很快,通常这是与目标数据库中记录的个数无关的,它只与把数据空间分为多少个单元有关。代表算法有:STING算法、CLIQUE算法、WAVE-CLUSTER算法;
5. 基于模型的方法(model-based methods)
基于模型的方法给每一个聚类假定一个模型,然后去寻找能个很好的满足这个模型的数据集。这样一个模型可能是数据点在空间中的密度分布函数或者其它。它的一个潜在的假定就是:目标数据集是由一系列的概率分布所决定的。通常有两种尝试方向:统计的方案和神经网络的方案。

⑧ 怎么用Matlab计算聚类算法的正确率问题

我把K-mediods的matlab代码贴出来,你好好学习一下
function label = kmedoids( data,k,start_data )
% kmedoids k中心点算法函数
% data 待聚类的数据集,每一行是一个样本数据点
% k 聚类个数
% start_data 聚类初始中心值,每一行为一个中心点,有cluster_n行
% class_idx 聚类结果,每个样本点标记的类别
% 初始化变量
n = length(data);
dist_temp1 = zeros(n,k);
dist_temp2 = zeros(n,k);
last = zeros(n,1);
a = 0;
b = 0;
if nargin==3
centroid = start_data;
else
centroid = data(randsample(n,k),:);
end
for a = 1:k
temp1 = ones(n,1)*centroid(a,:);
dist_temp1(:,a) = sum((data-temp1).^2,2);
end
[~,label] = min(dist_temp1,[],2);
while any(label~=last)
for a = 1:k
temp2 = ones(numel(data(label==a)),1);
temp3 = data(label==a);
for b = 1:n
temp4 = temp2*data(b,:);
temp5 = sum((temp3-temp4).^2,2);
dist_temp2(b,a) = sum(temp5,1);
end
end
[~,centry_indx] = min(dist_temp2,[],1);
last = label;
centroid = data(centry_indx,:);
for a = 1:k
temp1 = ones(n,1)*centroid(a,:);
dist_temp1(:,a) = sum((data-temp1).^2,2);
end
[~,label] = min(dist_temp1,[],2);
end
end

⑨ sparkr做kmeans 聚类能指定迭代次数吗怎么指定

我把K-mediods的matlab代码贴出来,你好好学习一下

function label = kmedoids( data,k,start_data )
% kmedoids k中心点算法函数
% data 待聚类的数据集,每一行是一个样本数据点
% k 聚类个数
% start_data 聚类初始中心值,每一行为一个中心点,有cluster_n行
% class_idx 聚类结果,每个样本点标记的类别
% 初始化变量
n = length(data);
dist_temp1 = zeros(n,k);
dist_temp2 = zeros(n,k);
last = zeros(n,1);
a = 0;
b = 0;

if nargin==3
centroid = start_data;
else
centroid = data(randsample(n,k),:);
end
for a = 1:k
temp1 = ones(n,1)*centroid(a,:);
dist_temp1(:,a) = sum((data-temp1).^2,2);
end
[~,label] = min(dist_temp1,[],2);
while any(label~=last)
for a = 1:k
temp2 = ones(numel(data(label==a)),1);
temp3 = data(label==a);
for b = 1:n
temp4 = temp2*data(b,:);
temp5 = sum((temp3-temp4).^2,2);
dist_temp2(b,a) = sum(temp5,1);
end
end
[~,centry_indx] = min(dist_temp2,[],1);
last = label;
centroid = data(centry_indx,:);
for a = 1:k
temp1 = ones(n,1)*centroid(a,:);
dist_temp1(:,a) = sum((data-temp1).^2,2);
end
[~,label] = min(dist_temp1,[],2);
end

end

⑩ 请高手帮忙编写关于K—mediods算法的MATLAB程序用于处理Iris数据集的聚类处理,得到迭代次数图形和准确率

我把K-mediods的matlab代码贴出来,你好好学习一下

function label = kmedoids( data,k,start_data )
% kmedoids k中心点算法函数
% data 待聚类的数据集,每一行是一个样本数据点
% k 聚类个数
% start_data 聚类初始中心值,每一行为一个中心点,有cluster_n行
% class_idx 聚类结果,每个样本点标记的类别
% 初始化变量
n = length(data);
dist_temp1 = zeros(n,k);
dist_temp2 = zeros(n,k);
last = zeros(n,1);
a = 0;
b = 0;

if nargin==3
centroid = start_data;
else
centroid = data(randsample(n,k),:);
end
for a = 1:k
temp1 = ones(n,1)*centroid(a,:);
dist_temp1(:,a) = sum((data-temp1).^2,2);
end
[~,label] = min(dist_temp1,[],2);
while any(label~=last)
for a = 1:k
temp2 = ones(numel(data(label==a)),1);
temp3 = data(label==a);
for b = 1:n
temp4 = temp2*data(b,:);
temp5 = sum((temp3-temp4).^2,2);
dist_temp2(b,a) = sum(temp5,1);
end
end
[~,centry_indx] = min(dist_temp2,[],1);
last = label;
centroid = data(centry_indx,:);
for a = 1:k
temp1 = ones(n,1)*centroid(a,:);
dist_temp1(:,a) = sum((data-temp1).^2,2);
end
[~,label] = min(dist_temp1,[],2);
end

end

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