并行编译
Ⅰ 我们来讲解以下如何才能编写并行程序,以及如何编译运行
我们下面以C 语言为例。
具体语法规则可参看《高性能计算并行编程技术-MPI 并行程序设计》一书。
mpicc -o outfilename cpi.c
其中outfilename 为编译后的输出文件,cpi.c 为源代码.
可将cpi.c 下载后上传的自己目录下编译.
例如:mpicc -o cpi cpi.c
如没有安装OpenPBS 则:
mpirun -np 4 cpi
否则:(一般安装了)
之后需写一作业提交脚本.例如:submit 内容如下:
#PBS -l nodes=nodes number
#PBS -N jobname#PBS -j oecd /home/xmin/Project
/usr/local/bin/mpiexec cpi
其中 #PBS -l nodes=nodes number 为指定几个节点计算.如: nodes=4
#PBS -N jobname 为用户命名的提交作业名称.如: #PBS -N xmin
#PBS -j oe 为结果和错误输出同文件.如无此项则分别在两个文件中.
cd /home/xmin/Project 编译后的输出文件所在路径(从根目录开始).
/usr/local/bin/mpiexec cpi 为mpiexec 所在路径.
下面是完整例子:
#PBS -l nodes=4
#PBS -N xmin#PBS -j oecd /home/xmin/Project
/usr/local/bin/mpiexec cpi
提交脚本如下:
qsub submit得到如下:3565.isc.math.nankai.e.cn
此为你的作业编号.
这样你就可得到类似xmin.o2666 的文件,打开即可看到结果.
你还可以查询作业提交情况.命令如下:qstat
Ⅱ 目前处理并行编译技术有哪几种方法
三种形式编辑
时间并行
时间并行指时间重叠,在并行性概念中引入时间因素,让多个处理过程在时间上相互错开,轮流重叠地使用同一套硬件设备的各个部分,以加快硬件周转而赢得速度。?
时间并行性概念的实现方式就是采用流水处理部件。这是一种非常经济而实用的并行技术,能保证计算机系统具有较高的性能价格比。目前的高性能微型机几乎无一例外地使用了流水技术。
空间并行
空间并行指资源重复,在并行性概念中引入空间因素,以“数量取胜”为原则来大幅度提高计算机的处理速度。大规模和超大规模集成电路的迅速发展为空间并行技术带来了巨大生机,因而成为实现并行处理的一个主要途径。空间并行技术主要体现在多处理器系统和多计算机系统。但是在单处理器系统中也得到了广泛应用。?
时间并行+空间并行
指时间重叠和资源重复的综合应用,既采用时间并行性又采用空间并行性。显然,第三种并行技术带来的高速效益是最好的。
Ⅲ vasp5.3并行编译错误,求助
./configure --prefix=/opt/openmpi-1.6.5 CC=icc CXX=icpc FC77=ifort FC=ifort 貌似这样不行,能直接进文本改么。。。像vasp那样
Ⅳ linux下如何配置MPI,如何在MPI环境下编译fortran并行程序
先安装 MPICH
然后可以用 mpif77,这个其实是调用 gfortran 等编译器的脚本而已
Ⅳ vasp5.2 并行编译如何修改makefile
1.用intel编译mpi
2.设置好编译器和数学库的路径,source使生效
3.在makefile里,修改编译器,打开mpi部分并注释掉前面的串行部分
4.make吧
Ⅵ 在64位系统上并行编译fluent15的udf出现 hash.h无法 请问解决了吗
连动数码不错,可以解决你这样的问题。(方法:打开手机qq->动态->兴趣部落->搜索:连动数码->关注->发帖) 追踪着鹿的猎人是看不见山的ifAmf4bwN詹吵
Ⅶ lammps 可以同时编译 并行 和 单核吗
并行技术可分为三类,分别是线程库、消息传递库和编译器支持。线程库(如 POSIX* 线程和 Windows* API 线程)可实现对线程的显性控制;如果需要对线程进行精细管理,可以考虑使用这些显性线程技术。借助消息传递库(如消息传递接口〔MPI〕),应用程序可同时利用多台计算机,它们彼此间不必共享同一内存空间。MPI 广泛应用于科学计算领域。第三项技术是在编译器中实现的线程处理支持,采用的形式自动并行化。一旦将线程处理引入到应用程序中,开发人员就可能要面对一系列新的编程缺陷(Bug)。其中许多缺陷是难以检测到的,需要付出额外的时间和关注以确保程序的正确运行。一些比较常见的线程处理问题包括:数据争用 ,同步,线程停顿 ,锁 ,共享错误.
并行技术可以分为多进程编程和多线程编程。人们总会用某种IPC(inter-process communication,进程间通信)的形式来实现进程间同步,如管道(pipes),信号量(semaphores),信息队列(message queues),或者共享存储(shared memory)。在所有的这些IPC形式中,共享存储器是最快的(除了门(doors)之外)。在处理进程间资源管理,IPC和同步时,你可以选择 POSIX或者System V的定义。
线程技术早在20世纪60年代就被提出,但真正应用多线程到操作系统中还是在20世纪80年代中期。现在,多线程技术已经被许多操作系统所支持,包括Windows NT/2000和Linux。
在1999年1月发布的Linux 2.2内核中,进程是通过系统调用fork创建的,新的进程是原来进程的子进程。需要说明的是,在Linux 2.2.x中,不存在真正意义上的线程,Linux中常用的线程Pthread实际上是通过进程来模拟的。
也就是说,Linux中的线程也是通过fork创建的,是“轻”进程。Linux 2.2缺省只允许4096个进程/线程同时运行,而高端系统同时要服务上千的用户,所以这显然是一个问题。它一度是阻碍Linux进入企业级市场的一大因素。
2001年1月发布的Linux 2.4内核消除了这个限制,并且允许在系统运行中动态调整进程数上限。因此,进程数现在只受制于物理内存的多少。在高端服务器上,即使只安装了512MB内存,现在也能轻而易举地同时支持1.6万个进程。
在Linux 2.5内核中,已经做了很多改进线程性能的工作。在Linux 2.6中改进的线程模型仍然是由Ingo Molnar 来完成的。它基于一个1:1的线程模型(一个内核线程对应一个用户线程),包括内核内在的对新NPTL(Native Posix Threading Library)的支持,这个新的NPTL是由Molnar和Ulrich Drepper合作开发的。
2003年12月发布的Linux 2.6内核,对进程调度经过重新编写,去掉了以前版本中效率不高的算法。进程标识号(PID)的数目也从3.2万升到10亿。内核内部的大改变之一就是Linux的线程框架被重写,以使NPTL可以运行其上。
在现代操作系统里,同一时间可能有多个内核执行流在执行,因此内核其实象多进程多线程编程一样也需要一些同步机制来同步各执行单元对共享数据的访问。尤其是在多处理器系统上,更需要一些同步机制来同步不同处理器上的执行单元对共享的数据的访问。在主流的Linux内核中包含了几乎所有现代的操作系统具有的同步机制,这些同步机制包括:原子操作、信号量(semaphore)、读写信号量(rw_semaphore)、spinlock、BKL(Big Kernel Lock)、rwlock、brlock(只包含在2.4内核中)、RCU(只包含在2.6内核中)和seqlock(只包含在2.6内核中)。
现在的随着现在计算机体系结构的发展,指令级的并行和线程级的并行都在日新月异地发展着.
Ⅷ wien2k k点并行需要编译并行的wien吗
当某一地区干旱时,我要带上许多清凉的水,飞到干旱地区,让干旱地区的人们饮用,然后,我带着水,边飞边撒,下一场及时雨.
当某一地方大堤塌陷时,我要身扛几百万泥石袋,火速赶到,拯救沿海人民.
当某一地区发生超级大地震时,我要用健美的臂膀,把压在人们身上的碎石块,通通搬走.还要念魔法,让这一带恢复原状,让人们身上的伤口,快愈合.
当发生抢劫案时,我就会飞到坏蛋面前,一把揪住他的衣服,让坏蛋束手就擒.如若坏蛋不服,我就要使出超人派绝招—无敌连环拳,让坏蛋心服口服.
当发生不能预知的海啸时,我要用超能力变成一张无敌大膜,阻止海水前行,如果有人在划船的话,我就把头发变成钩子,钩住小船,然后把
小船拉到安全地带.这样,就不会有人员伤亡了.
Ⅸ linux下如何配置MPI,如何在MPI环境下编译fortran并行程序
先安装
MPICH
然后可以用
mpif77,这个其实是调用
gfortran
等编译器的脚本而已
Ⅹ 在64位系统上并行编译fluent15的udf出现 hash.h无法打开basetsd.h的问题,还请赐教,谢谢!
在网上下载一个basetsd.h文件放到与hash.h相同文件夹即可
http://vdisk.weibo.com/s/C4l708yjOPQ0O?category_id=0&parents_ref=C4l708yjOPQ2t,C4l708yjOPQ2u