oncomine資料庫
① 怎麼知道一個基因是否在某一腫瘤細胞中表達
人類結構基因4個區域:①編碼區,包括外顯子與內含子;②前導區,位於編碼區上游,相當於RNA5』末端非編碼區(非翻譯區);③尾部區,位於RNA3』編碼區下游,相當於末端非編碼區(非翻譯區);④調控區,包括啟動子和增強子等。基因編碼區的兩側也稱為側翼順序
② 求助關於ONCOMINE資料庫
您好,我來為您解答:
ONCOMINE資料庫
收費的,要用國外的郵箱才可以注冊的!
要用非盈利科研機構的郵箱才可以注冊,比如科研院所。大部分數據是免費的
希望我的回答對你有幫助。
③ 如何查找某個基因或蛋白在各組織器官的表達分布
TIMER、oncomine,GEPIA資料庫均可
④ oncomine資料庫關閉
1)選擇「文件」選項卡,單擊「關閉資料庫」命令。
2)選擇「文件」選項卡,單擊「退出」命令。
3)單擊資料庫窗口標題欄的「關閉」按鈕。
4)雙擊「控制」按鈕5)按Alt+F4組合鍵
⑤ 如何快速掌握TCGA資料庫
參加培訓班——最快速的方法。有些生物信息公司會針對高校教師和醫師開生信培訓班,我導師帶著我上過幾次,有TCGA、Oncomine和R的。缺點是價格貴,一次一天兩三千,優點是上手快,而且會有後續服務,比如課上完後你在qq群里提問,一般公司技術人員都會給你解決。我放幾張上完培訓班後發的資料,是課上PPT轉的PDF。另外再推薦一本中文教材,可以做補充用。優點是淺顯易懂,缺點是不夠深入且作者態度傲嬌,但書還可以,《R語言與Bioconctor-生物信息學應用》,隨著大數據時代的到來,各種生物類公共資料庫井噴,其中就包括癌症領域熟為人知的癌症基因圖譜The Cancer Genome Atlas (TCGA)資料庫。TCGA由NCI牽頭,作為美國攻克癌計劃的一個大項目,投入了巨大的人力和物力,系統提供了癌症多組學測序和晶元數據,包括Gene expression, DNA methylation, Copy NumberVariation, Mutation等結果,同時也附有相應各測序樣本的完整臨床資料。TCGA為腫瘤基礎醫學和轉化醫學研究者提供了海量的基因組數據和與其關聯的臨床數據,這為挖掘有意義的基因組變化和發現影響腫瘤起始、發展、分化、轉移等生物學機制提供了海量數據基礎。然而傳統的基礎醫學和轉化醫學研究者缺乏信息學基礎來處理大規模癌症數據,因而在面對這些極其有價值的基因組數據時,往往心有餘而力不足。作為醫學信息領域研究者,我們需要將信息學和統計學知識運用到癌症基因組學數據分析的研究當中,作為連接大數據與基礎醫學研究者之間的一個紐帶,幫助研究者去更好地挖掘探索這些數據。
⑥ oncomines 資料庫中no value 組代表什麼標本
根據名稱是無數值或者無價值 無意義的標本吧。
⑦ swab和pcr有分別嗎
有的。
TIMER資料庫對單基因的差異分析,尤其是與腫瘤浸潤免疫細胞表型相關的分析,特別適用,可以做到統籌兼顧,有局部聚焦oncomine和全局通覽。
mRNA水平研究表達差異,而人類蛋白組資料庫Human則是主要從蛋白也有mRNA角度展示基因表達的差異。
⑧ oncomine資料庫怎樣比較兩個基因的相關性
第一,A的表達產物可能是B的轉錄因子,直接調節B,反之亦有可能; 第二,A的表達產物間接調控B的轉錄,或反之; 實驗設計, 首先必須要確定兩者的相關性,不管是正的還是負的,可用wenstern和Qpcr的手段; 其次,要從文獻中或信號轉導通路中挖掘。
⑨ pan-cancer的基因表達在哪個資料庫
資料庫名稱:Oncomine資料庫。
基因表達差異分析(通過檢索基因表達譜差異,挖掘具有研究價值的靶分子,檢索特定研究靶分子,分析其在腫瘤中的表達情況),多基因共表達分析,Oncomine和TCGA相比的優勢就是,它除了數據,還提供了一些簡潔易操作的分析工具,如差異表達分析、共表達分析等,分析後可以直接出圖用在文章里。另外它還整合了TCGA和GEO的部分數據。
⑩ 求助關於ONCOMINE資料庫
您好,很高興為您解答:
由於您沒有提出實質的問題,所以無法給予您更詳細的回復,請您詳細的描述出現的問題,這樣才可以根據您的具體情況及出現的問題,提出針對性的解決方案。
希望以上信息可以幫到您!