mit資料庫
『壹』 生物催化和生物降解的資料庫及網址有哪些
一般來說所用的分析工具有在線跟下載的下面簡要列舉一些常用在線軟體的使用1、使用VecScreen工具,分析下列未知序列,輸出序列長度、載體序列的區域、可能使用的克隆載體都有哪些。一、步驟:
打開google首頁,搜索VecScreen,進入VecScreen首頁,復制序列,運行,Viewreport。
二、結果:
輸出序列長度918bp,載體序列的區域456bp——854bp.
克隆載體:M13mp18phage,pGEM-13Zf(),pBR322,pRKW2。
2、使用相應工具,分析下列未者帆知序列的重復序列情況,輸出重復序列的區域、包含的所有重復序列的類型、重復序列的總長度及MaskedSequence。
一、步驟:
進入google首頁,進入ICBI主頁,對序列進行BLAST。得出序列是human的。
進入google首頁,搜索,進入主頁,進入,復制序列,DNAsource選擇human,運行!點擊超鏈接,在結果中選擇
AnnotationFile:_1287631711.out.html
3、使用CpGPlot/CpGReport/Isochore工具,分析下列未知序列,輸出CpG島的長度、區域、GC數量、所佔首粗雹的百分比及Obs/Exp值。一、步驟:
進入google首頁,搜索CpGPlot,進入CpGPlot主頁,program中選擇cpgreport復制序列,運行!
二、結果:
CpG島的長度:385bp
區域:48——432;
GC數量:SumCG=297,百分數=77.14
Obs/Exp:1.01、4、預測下面序列的啟動子,輸出可能的啟動子序列及相應的位置。一、步驟:
進入google首頁,進入ICBI主頁,對序列進行BLAST。凳耐得出序列是human的
進入google首頁,搜索,進入主頁,復制序列,選擇eukaryote,運行!
二、結果:
位置:711—761,1388—1438,1755—1805;
5、運用SpliceSitePrediction工具分析下面序列,分別輸出內含子-外顯子剪接位點給體和受體的區域及剪接處位置的鹼基。一、步驟:
進入google首頁,進入ICBI主頁,對序列進行BLAST。得出序列是human的
進入google首頁,搜索SpliceSitePrediction,進入主頁,復制序列。Organism選擇Humanorother。其他默認,運行!
二、結果:
供體:
受體:
6、對下面序列進行六框翻譯,利用GENESCAN綜合分析(首先確定給定序列的物種來源)哪個ORF是正確的,輸出六框翻譯(抓圖)和GENESCAN結果(包括predictedgenes/exons和predictedpeptidesequence(s)兩個部分)。一、步驟:
進入google首頁,進入ICBI主頁,對序列進行BLAST。得出序列是Zea的
進入google首頁;搜索NCBI,進入主頁,選擇allresources(A~Z),選擇O,選擇ORFfinder。復制序列,默認,運行!
二、結果:ORF圖
三、步驟:進入google首頁,搜索GENESCAN,進入主頁,Organism:Maize,,其他默認,運行!
四、結果:
G7、進入REBASE限制性內切酶資料庫,輸出AluI、MboI、EcoI三種內酶的RecognitionSequence和Type。
一、步驟:進入google首頁,googleinEnglish,搜索REBASE,進入主頁,分別輸入AluI、MboI、EcoI,運行!
在MboI中選擇第一個,EcoI選擇第二個。
二、結果:
ENSCAN圖
8、使用引物設計工具,針對下列未知序列設計一對引物,要求引物長度為20-25bp,擴增產物長度300-500bp,退火溫度為50-60℃。請寫出選擇的一對引物(ForwardPrimerandReversePrimer)、及相應的GC含量、引物的位點、Tm值和產物長度。一、步驟:進入google首頁,搜索genefisher,進入主頁,復制fasta格式,chechkinput,sunmit,;;設置一下引物長度為20-25bp,擴增產物長度300-500bp,退火溫度為50-60℃;。
二、結果:
GC含量:
引物的位點:
Tm值:
產物長度:。
9、將下面的序列用NEBcutter2.0工具分析,用產生平末端及有四個酶切位點的酶進行酶切,並用抓圖提交膠圖(viewgel),要求1.4%agarose和Marker為100bpDNALadder。
一、步驟:
進入google首頁,進入ICBI主頁,對序列進行BLAST,得知是linear。
進入google首頁,搜索NEBcutter2.0,進入主頁,選擇linear,運行!選擇customdigest,,把「1」改為「4」,選擇平末端,後digest。Viewgel。選擇1.4%agarose和Marker為100bp。
二、結果:
然後就是蛋白質的了一般都在expasy里swiss-prot適用於檢索的computepi/mw求理論分子量分子量protparam物理化學性質protscale親水性疏水性peptidemass分析蛋白酶和化學試劑處理後的內切產物
NCBI(www.ncbi.nlm.nih.gov)-GenBank資料庫
資料庫相似性搜索——核酸序列與核酸資料庫比較(BLASTN)
蛋白質序列與資料庫中蛋白質序列比較(BLASTP)
兩序列比對(Aligntwosequences)
DNA序列分析——ORFFinder(www.ncbi.nlm.nih.gov/gorf/gorf.html)
分析實驗序列外顯子部分——GENSCAN(genes.mit.e/GENSCAN.html)
分析實驗序列的可能酶切位點——NEBcutter2.0(tools.neb/NEBcutter2/index.php)
註:Customdigest--viewgel
限制性內切酶資料庫——REBASE(rebase.neb/rebase/rebase.html)
設計引物擴增實驗序列——Genefisher
Primer3
蛋白質序列分析及結構預測:
1.預測蛋白質的分子量及等電點:ExPASy(ComputepI/Mw)
2.分析蛋白質的基本物理化學性質:ExPASy(ProtParam)
3.分析蛋白質的親水性和疏水性:ExPASy(ProtScale)
4.分析蛋白質在各種蛋白酶和各種化學試劑處理後的內切產物:ExPASy(PeptideMass)[*:kinaseK]
5.分析蛋白質的信號肽:ExPASy(SignalP)
6.預測蛋白質的二級結構:ExPASy(Jpred3)
多物種分子系統發育分析:EMBL(www.ebi.ac.uk/embl/)--Toolbox--Clustal2W
人脂聯素蛋白質序列:NP_004788
人類胰島素生長因子IB前體:P05019
『貳』 如何使用其它高校,如MIT、清華大學等,的 資料庫 在線等,求高手指教.
曾經見多有本校學生在外面也可以使用本校的資料庫的,估計是有與學校關聯的軟體才行。
『叄』 MIT-BIH心電資料庫裡面有正常的心電信號嗎
有;
MIT-BIH 是由美國麻省理工學院提供的研究心律失常的資料庫。目前國際上公認的可作為標準的心電資料庫有三個,分別是美國麻省理工學院提供的MIT-BIH 資料庫,美國心臟學會的AHA資料庫以及歐洲AT-T心電資料庫。其中MIT-BIH 資料庫近年來應用比較廣泛。
MIT-BIH 的數據格式:
MIT-BIH 為了節省文件長度和存儲空間,使用了自定義的格式。一個心電記錄由三個部分組成:
(1)頭文件[.hea],存儲方式ASCII碼字元。
(2)數據文件[.dat],按二進制存儲,每三個位元組存儲兩個數,一個數12bit。
(3)注釋文件[.art],按二進制存儲。
『肆』 資料庫刪除語句怎麼寫
問題一:刪除資料庫的sql語句如何寫? drop database 資料庫名 --刪除資料庫的
drop table 表名--刪除表的
delete from 表名 where 條件 --刪除數據的
truncate table 表名 也是刪除資料庫的.但是他可以裁斷序列 這個你跟DELETE 對照試一下就知道了
問題二:資料庫中如何用語句刪除表中的列 各主流資料庫用法如下:
sqlserver:
alter table 表名 drop column 列名;oracle:
alter table 表名 drop column 列名;mysql:
alter table 表名 drop column 列名;總結:在主流資料庫下,刪除列的語法是一致的,並無差別。
問題三:oracle資料庫刪除表中一條數據SQL語句 delete from 表名 where 條件
mit; 提交
問題四:SQL 刪除語句怎麼寫呢? 其實我覺得你應該寫成
delete from studentInfo where stuid = 『2』試試,像你說的如果不是ID欄位類型不是int,應該是不會出現這種情況的,你試試,不行再想別的辦法
當然下面的語句也打上引號試試:
stmt.executeUpdate(delete from studentInfo where stuid = '攻+studentBean.getStuID()+' ) ;
試試吧,祝你好運!
問題五:sql 刪除語句 5分 DELETE 語句
DELETE 語句用於刪除表中的行。
語法
DELETE FROM 表名稱 WHERE 列名稱 = 值
刪除某行
DELETE FROM 表名稱 WHERE 列名稱 = 值(刪除條件)
刪除所有行
可以在不刪除表的情況下刪除所有的行。這意味著表的結構、屬性和索引都是完整的:
DELETE FROM 表名 或者:
DELETE * FROM 表吵團名
通過使用 DROP 語句,可以輕松地刪除索引、表和資料庫
DROP INDEX 索引名稱
DROP TABLE 表名侍亂稱
DROP DATABASE 資料庫名稱
不刪除表,只刪除表中的數據
TRUNCATE TABLE 表名稱
問題六:這句 sql 刪除語句怎麼寫 de唬ete from student where name='ABC';
delete from student where name in('ABC','AB','X','YXA');
問題七:oracle 刪除sql語句怎麼寫 首先你要明確你要刪什麼東西
如果是刪除一個表裡面的數據,那你要明確是全表刪除還是只刪除某一部分數據
表刪除語句: delete from 表名where 要刪除的條件;
如果是全表刪除可以這樣寫升談橘:delete from 表名,或者直接裁剪表 truncate table 表名;
問題八:mysql中刪除表中所有數據的sql語句怎麼寫 清空全部數據,不可恢復,速度快
truncate table 表名
清空全部數據,數據可恢復,速度慢delete from 表名
問題九:php刪除sql資料庫的語句 啥意思?sql語句我寫不全,寫個大概意思
Delete where iid='75839';
問題十:MYSQL的刪除語句怎麼寫 用NOT IN
DELETE FROM A where UID not in (select UID from B)