dgv資料庫
㈠ 常用醫學中文資料庫有哪幾種,有何特點
醫學文獻常用資料庫:Pubmed
我常用很多跟遺傳病有關的資料庫,有:OMIM(人類孟德爾遺傳資料庫)、HGMD(人類基因突變資料庫)、Clinvar(NCBI臨床突變資料庫)、gnomAD(人群頻率資料庫)、dbSNP(人群頻率資料庫)、InterVar(位點致病性評判)、GeneReviews(疾病資料庫)、PharmGKB(葯物基因組資料庫)、常用預測軟體資料庫。
跟CNV分析有關的數據:DGV(基因組變異資料庫)、Decipher(拷貝數變異資料庫)、ClinGen資料庫(劑量敏感判斷資料庫)、UCSC Genome Browser(基因組瀏覽器)。
表型庫:HPO(人類本體表型庫)、CHPO
上面是我常用的資料庫,不知是不是您問的內容,當然查文獻最多還是在pubmed。
㈡ 在dgv中如何顯示排名
直接在sql語句後面加orderby列名就能顯示排名了。
DGV代表資料庫的猛帆蘆基因組變異,除了資料庫的基因組變異,DGV還有其他含義,DGV的縮寫廣泛應用轎攜於銀行、計算機、教育、金融、枝帶政府和衛生等行業。
㈢ dbvar是什麼意思
#What is 'dbVar'?
dbVar is the NCBI database of genomic structural variation. For information on how to navigate dbVar see the dbVar Help page.
#How does dbVar differ from the Database of Genomic Variants (DGV)?
DGV has been a useful resource for the human genetics community with respect to collecting and curating structural variation data for human. DGV are now working with DGVa to extend service and we are working with DGVa to exchange data. Additionally, DGV only contains data for healthy control human samples, while dbVar accepts data from all species and includes clinical data.
#What is 『structural variation』?
Structural variation (SV) is generally defined as any region of DNA involved in inversions and balanced translocations or genomic imbalances (insertions and deletions), commonly referred to as number variants (CNVs). For more information see the Overview of Structural Variation page.
#What types of structural variation data does dbVar accept?
dbVar is a structural variation database designed to store data on variant DNA ≥ 1 bp in size. Single Nucleotide Polymorphism (SNP) data should be submitted to dbSNP.
#什麼是'dbVar'?
dbVar是基因組結構變異NCBI資料庫。有關如何導航dbVar看到dbVar幫助頁的信息。
#如何dbVar不同於基因組變異資料庫(DGV)?
DGV就一直為社會人類遺傳學有用的資源收集和策劃人的結構變化的數據。 DGV正與DGVa延長服務,我們與DGVa合作,交換數據。此外,DGV只包含人類健康對照樣本數據,而dbVar接受來自所有物種的數據,包括臨床資料。
#什麼是'結構變異'?
結構變異(SV)的一般定義為任何的DNA和平衡易位或倒位(插入和刪除)基因不平衡有關區域,通常被稱為拷貝數變異(CNVs中)。欲了解更多信息,請參閱結構變化網頁概述。
#什麼樣的結構變化的數據類型有dbVar接受嗎?
dbVar是一個結構性的變化存儲在資料庫設計的大小變異的DNA≥1基點數據。單核苷酸多態性(SNP)的數據應提交dbSNP。