微衛星資料庫
㈠ 手機的ssr模式是什麼哦
不懂哎 、這是在網上查的。、SSR在固體繼電器中固體繼電器( SSR) 是一種全部由電子元器件組成的新型無觸點開關器件,具有高可靠性、長壽命、低噪音、開關速度快、抗干擾能力強、耐振動、耐沖擊、防濕、防潮、防腐蝕、能與TTL 、CMOS 等邏輯電路兼容的優點,逐漸被越來越多的應用領域所接受。在電力無功補償的控制領域中,對於免維護設備的操作要求,傳統的交流接觸器控制容性負載受到了巨大的挑戰。雖然通用交流SSR 以其獨特的過零導通的特點被廣大用戶所青睞,但是對於高電壓高沖擊電流的容性負載,通用交流SSR 難以滿足控制要求,制約著SSR 在這一領域的推廣應用。 SSR可分為交流和直流兩種,是通過較低的電壓(DC3V~32V)來觸發晶閘管(單向或雙向可控硅),使其負載端導通,輸出較高的直流或交流,從而達到通過較低電壓來控制較高電壓或較強電流的目的。與普通的交流接觸器相比,其在導通及截止時不會產生電火花現象。 編輯本段SSR在簡單重復序列中 簡單重復序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 簡單重復序(SSR)也稱微衛星DNA,其串聯重復的核心序列為1一6 bp,其中最常見是雙核苷酸重復,即(CA) n和(TG) n每個微衛星DNA的核心序列結構相同,重復單位數目10一60個,其高度多態性主要來源於串聯數目的不同。SSR標記的基本原理:根據微衛星序列兩端互補序列設計引物,通過PCR反應擴增微衛星片段,由於核心序列串聯重復數目不同,因而能夠用PCR的方法擴增出不同長度的PCR產物,將擴增產物進行凝膠電泳,根據分離片段的大小決定基因型並計算等位基因頻率。在真核生物中,存在許多2-5bp簡單重復序列,稱為「微衛星DNA」其兩端的序列高度保守,可設計雙引物進行PCR擴增,揭示其多態性。 SSR具有以下一些優點:(l)一般檢測到的是一個單一的多等位基因位點;(2)微衛星呈共顯性遺傳,故可鑒別雜合子和純合子;(3)所需DNA量少。顯然,在採用SSR技術分析微衛星DNA多態性時必須知道重復序列兩端的DNA序列的信息。如不能直接從DNA資料庫查尋則首先必須對其進行測序。 編輯本段SSR在系統服務代表中 SSR(System Services Representive ) Job description: The System Services Representive (SSR) is primarily responsible for the post sale maintenance of IBM hardware and software in customer account. The SSR performs services activities including stsems assurance, installation planning, account management, system problem determination, discontinuances, relocation, diagnosis etc. Job Requirement: 1. Teamwork, account management, situation handling 2. Communication Skill 3. Good at Writing and Oral English 4. AIX, Unix or Linux related Experiences is a good plus 5. Bachelor's Degree or above 編輯本段SSR在數理統計中 SSR(新復極差法) LSR(最小顯著極差法) 方差分析結束後,固定模型下需要對存在顯著差異的幾組處理進行多重比較,常用的方法有最小顯著差數法(LSD)和最小顯著極差法(LSR)。其中最小顯著差數法中只應用一個尺度LSDα對a(a-1)/2對數據進行多重比較,會使犯第一類錯誤的機會增大;最小顯著極差法先將數據排序,根據位置差異採用不同的比較標准。 LSR法檢驗統計量計算有Duncan於1955年提出的新復極差法(SSR法)和Tukey於1949年提出的q法: SSR=(xi.-xj.)/SE~SSR(p,fe) q=(xi.-xj.)/SE~q(p,fe) SE=(MSe/r)開平方 詞條圖冊更多圖冊 擴展閱讀: 1 http://ke..com/view/660796.htm開放分類: 物理學,電學,分子生物學,生物技術,分子標記 「SSR」在英漢詞典中的解釋(來源:網路詞典): SSR abbr. 1. =Soviet Socialist Republic 前蘇維埃社會主義共和國
ssr abbr. 1. =secondary surveillance radar 輔助監視雷達
㈡ SSR分子標記的原理
簡單重復序列(Simple Sequence Repeat,SSR) 簡單重復序(SSR)也稱微衛星DNA,其串聯重復的核心序列為1一6 bp,其中最常見是雙核苷酸重復,即(CA) n和(TG) n每個微衛星DNA的核心序列結構相同,重復單位數目10一60個,其高度多態性主要來源於串聯數目的不同。SSR標記的基本原理:根據微衛星序列兩端互補序列設計引物,通過PCR反應擴增微衛星片段,由於核心序列串聯重復數目不同,因而能夠用PCR的方法擴增出不同長度的PCR產物,將擴增產物進行凝膠電泳,根據分離片段的大小決定基因型並計算等位基因頻率。在真核生物中,存在許多2-5bp簡單重復序列,稱為「微衛星DNA」其兩端的序列高度保守,可設計雙引物進行PCR擴增,揭示其多態性。 SSR具有以下一些優點:(l)一般檢測到的是一個單一的多等位基因位點;(2)微衛星呈共顯性遺傳,故可鑒別雜合子和純合子;(3)所需DNA量少。顯然,在採用SSR技術分析微衛星DNA多態性時必須知道重復序列兩端的DNA序列的信息。如不能直接從DNA資料庫查尋則首先必須對其進行測序。 SSR的分類 根據SSR核心序列排列方式的不同,可分為3種類型: 完全型(perfect)。指核心序列以不間斷的重復方式首尾相連構成的DNA。如: 不完全型(imperfect)。指在SSR的核心序列之間有3個以下的非重復鹼基,但兩端的連續重復核心序列重復數大於3 。如: 復合型(compound) 。指2個或2個以上的串聯核心序列由3個或3個以上的連續的非重復鹼基分隔開,但這種連續性的核心序列重復數不少於5 。如: 3種類型中完全型是SSR標記中應用較多的一種類型。 SSR在植物基因組中的分布 SSR廣泛分布於各種真核生物的基因組中,大約每隔10~50kb就存在一個SSR。哺乳動物中的SSR的數量大約為植物中的5~6倍。在植物中,平均23.3kb就有一個SSR;雙子葉植物中的SSR數量大於單子葉植物,前者兩個SSR之間的平均間距為21.2kb,後者為64.6kb;核DNA中的SSR數量多於細胞質DNA中的SSR,絕大多數單鹼基重復型及2鹼基重復型SSR存在於非編碼區,3鹼基重復型多位於編碼區。 微衛星的利用價值 由於核心序列重復數的不同,等位的SSR位點可呈現出多態性(SSLP,simple sequence length polymorphism)。大多表現為共顯性遺傳,有的表現為顯性遺傳。由於SSR DNA兩側序列(離開20bp以上)表現出保守特徵,所以可設計出上下游PCR引物,擴增出包含SSR的DNA序列。 微衛星分析常用於:遺傳圖譜構建;種質鑒定;遺傳多樣性分析;標記輔助選擇(MAS,marker- assistant seletion,marker- aided seletion);基因定位;數量性狀基因座(QTL)分析;系譜分析;親源關系鑒定等。 SSR引物的來源 借鑒其他近緣種序列。 通過篩選文庫、測序開發自己的SSR引物。 通過核酸資料庫查詢,從已有序列中搜尋包括SSR的序列並設計引物。 SSR分析實驗的主要技術環節 提取DNA;PCR擴增;電泳及顯色;電泳膠板帶型的照相、記錄;數據分析處理。 其中,PCR產物分離的電泳方法主要有:高濃度瓊脂糖電泳(4%膠只能分辨4-6bp差異);變性聚丙烯醯胺序列膠電泳;非變性聚丙烯醯胺凝膠電泳。 由於擴增的片段短(一般小於300bp),基因間的差異小(一般為幾個bp),故通常使用解析度高的聚丙烯醯胺凝膠電泳。在程序上,變性膠雖然比非變性膠麻煩些,但考慮到在非變性膠上會出現人為假象—異源雙鏈分子,比如導致SSR雜合子中出現3-4條帶,而不是正常的2條帶,從而干擾等位位點統計,因此我們建議在SSR分析中均採用變性膠電泳。
㈢ Y-STR方法首次成功應用!它「神」在哪兒
近日,懸而未決的甘肅白銀系列強奸殺人案件宣布成功告破,真凶高承勇這個系列殺人狂終於在逍遙法外28年之久後被捕歸案。公安機關最後緝捕真凶的技術簡稱為Y-STR技術。幫助據信該技術是我國在破解疑難懸案方面的首次成功應用。那麼這個技術到底「神」在哪兒?
何為Y-STR技術?
Y-STR的中文意思為Y-染色體DNA連續重復片段,是英文Y-ChromosomeShort Tandem Repeat的縮寫。該技術就屬性而言是一種人類個體遺傳基因的檢測和識別技術。要搞清楚它「神」在哪兒,首先要知道它具體是怎麼一回事兒。這還得從什麼是STR,即DNA連續重復片段說起。
STR(ShortTandem Repeat)就是大家可能聽說過的DNA指紋。生物遺傳基因在其DNA序列上存在兩個或三個鹼基連續多次重復的現象,簡稱為STR。大家知道我們人類的遺傳基因DNA在化學上由脫氧核糖核酸組成,單個鹼基通常被A、G、C或T這四個字母表示。實際上,地球所有生物的遺傳基因在AGCT鹼基構成層面是完全一樣的,所不同的是每一個物種的鹼基排列順序不一樣。開始於上世紀80年代的人類基因組計劃的直接目標就是准確給出這些核苷鹼基的排列順序,人類基因組的序列已經准確測出,鹼基總數30億個左右,分布在23條染色體上。上世紀70年代科學家就發現,幾乎所有高等生物的DNA序列中廣泛分布著簡單串聯重復序列,如CACACA,或GACGACGAC,少則串聯十幾次,多則上百次。有趣的是這些串聯重復序列(學術上也叫微衛星)的確切生物學功能至今未知,不少科學家至今仍在潛心研究並先後提出了多種假說。然而,科學家很快發現這些簡單重復序列的重復次數在個體間變異幅度很大,甚至同一基因位點在同一家庭兄弟姐妹間就有差異,成為區分個體的重要遺傳標志。這種鹼基水平的差異可能與DNA在復制時這個區段容易出現滑動錯誤有關,變異程度相對最高。歪打正著,在實踐中非常有用的DNA指紋技術從此誕生了。科學家後來發現,不僅人類,幾乎全部高等動物和植物都有這類DNA序列重復。DNA指紋作為一種精確的基因位點識別技術現在被廣泛應用於人類、動物、植物物種或品種標記或識別,在公安破案上已經被越來越多地應用。
而Y-STR則特指僅存在於人類男性體內Y-染色體DNA上的簡單重復序列。人類除了有22對常染色體,還有一對決定性別的性染色體,即X染色體和Y染色體。男性的性染色體配對是XY型,女性是XX型。人類個體的性別在精子與卵子結合的那一剎那間被決定。受精時如果一個含Y染色體的精子攻入一個卵子,這個受精卵將會發育成男孩,反之一個X精子與一個卵母細胞結合則會是女孩。說到這里大家就知道了,原來Y-STR技術是一種專用於識別男性或雄性個體的DNA指紋技術。這項技術神就神在它能夠以極其高的准確概率識別樣本中(組織、細胞、血液、體液、頭發、甚至指紋)的Y-STR重復狀態,只要有對比資料,就能科學無誤地判定二者是否為同一個體。
神奇之處:Y-STR在公安破案中可以大幅縮小破案范圍至犯罪嫌疑人的父系家族
Y-STR神奇的地方就在於公安破案中可以大幅縮小破案范圍至犯罪嫌疑人的父系家族。Y-染色體只傳男性不傳女性。同一父系家族的直系父子或旁系兄弟之間,Y-STR通常變化極小或沒有變化,其變異率遠遠低於非同系男性之間,這就為依賴Y-STR分型鎖定范圍提供了科學依據。實際上,甘肅白銀案就是靠犯罪嫌疑人堂兄因盜竊犯罪留下的Y-STR證據與上述白銀案犯罪現場獲得的同類證據資料對比而找到真凶的。因為在鎖定的高姓嫌疑人中,唯有真凶高承勇有作案條件。在我們國家還沒有建立起高覆蓋率的DNA指紋庫,特別是Y-STR庫之前,這不能不說是神奇或幸運,具備一定的偶然性。
當然除了Y-STR技術,與之平行的還有人體指紋和相貌特徵識別技術,包括人眼瞳孔識別技術也是非常有用的精確個體識別技術。這些技術除了公安破案,在其他如人員特定場所出入、保安、保密、資格認定、救援辨別等已經在開始實際應用,可以大大提高效率。這些技術的綜合應用非常有助於提高公安案件偵破效率,有效彌補單一技術資料庫容量不足的缺陷。可以設想,如果一個國家建立起一個全民覆蓋的這類資料庫,絕大多數需要個體識別的各類公安或非公安案件幾乎可以在資料對比的瞬間得到科學答案。
編輯:紀阿黎
(專家:馬潤林,中國遺傳學會專家、中國科學院遺傳與發育生物學研究所研究員、博士、博士生導師,文章來自科普中國頭條創作與推送)
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㈣ 什麼是基因組掃描
全基因組掃描
遺傳分析仍是當前對致病相關基因識別、鑒定的主要方法,分為連鎖分析和關聯研究兩種。由於人類基因組多態性的研究以及SNP分型技術的發展,目前全基因組連鎖分析和關聯研究亦變得切實可行。根據研究規模的大小,可以將疾病遺傳分析分為以下幾類,即定位克隆、連鎖不平衡基因定位、全基因組候選基因分析、候選基因關聯研究和定位候選基因克隆,其中定位克隆、連鎖不平衡基因定位和全基因組候選基因分析均屬於全基因組掃描。
不管是單基因疾病還是多基因疾病,通常是先行全基因組掃描(genome scanning);將疾病相關位點定位於染色體某個區域,然後再行候選基因策略或連鎖不平衡分析,確定致病基因位點。如果利用家系進行連鎖分析,即採用定位克隆;若是利用群體樣本,則應用連鎖不平衡分析進行基因定位。全基因組掃描已成功地應用在許多疾病的致病相關基因克隆上,並取得了一定的成果。
全基因組掃描所利用的是在人類基因組大量存在的微衛星或SNP,雖然當前使用較多的仍是微衛星,但由於晶元技術的發展,全基因組高分布密度的商品化SNP晶元相繼面世(如Affymetrix公司的10k,100k和500k人基因組SNP晶元),越來越多的研究者使用SNP進行全基因組掃描。由於這些高密度的SNP晶元價格昂貴,不是一般的實驗室所能承受。
微衛星全基因組掃描的原理是利用特定的引物將某條染色體上特定位置的微衛星擴增出來,並進行分析。這種分析所使用的微衛星通常具有較高的多態性,在不同的個體其長度不盡相同(也就是微衛星基本單位重復次數的不同),而不同長度的PCR產物則代表某一位點不同的等位基因。該種分析方法實際上是利用平均分布於各條染色體上的密度約為10cM的微衛星,檢測每個微衛星是否存在與其鄰近的疾病相關基因座位連鎖。全基因組掃描並不能直接搜尋具體的疾病相關基因,而是通過研究均勻分布於整個基因組的微衛星標記來間接選擇其相關的基因座位。在得到陽性結果後,又可在這些陽性位點附近再加密微衛星標記或利用SNP,用同樣的方法來確定哪一個多態性位點與疾病連鎖的可能性最大等等。這樣在不斷地縮小分析范圍後,疾病相關基因定位的范圍也越來越精細。由於人類基因組序列已知,一旦發現了與疾病相關基因連鎖兩側的遺傳標記,根據標記位點的具體位置,我們就可以知道定位區域內所有的基因。因此,當定位區域確定後,在該區域內選擇候選基因直接進行測序,對所發現的突變在病人和對照組進行分型並分析,搜尋致病基因。另一個方法是直接從公共資料庫挑選候選基因編碼區、調控區(包括內含子)中的SNP,進行連鎖不平衡分析,確定致病基因。
雖然單個SNP的多態信息量(polymorphism information content,PIC)不如微衛星,但在相同的PIC值的要求下,SNP圖譜的密度為微衛星圖譜的2.25—2.5倍。因此在相同的信息提取效果下,利用10cM間隔的微衛星圖譜即300個左右的微衛星標記進行初期定位,與4cM解析度的約750個SNP圖譜差不多,顯然後者對基因定位的范圍更精細,因此利用SNP標記能檢測出微衛星標記不能探測到的疾病相關區域。隨著人類基因組的重測序和DNA晶元技術的不斷完善,目前已有應用於全基因組掃描的SNP晶元,如Affymetrix公司的GeneChip Mapping 500K ArraySet、100kArraySet和10k的SNP晶元(SNP數目分別約為50萬、10萬和1萬)。顯然這些晶元的SNP分布密度以及信息度大大高於定位克隆常規使用的微衛星,並已成功應用於疾病相關基因的研究。預計隨著SNP晶元的進一步完善和成本的降低,將是未來疾病相關基因研究的主流技術。
全基因組掃描用的成套微衛星引物,可多達上千個。引物的5』末端標記在激光激發下可發出不同顏色光的熒光素標記,如此可進行多重PCR,加速實驗的進程。每一樣本的PCR產物長度大小可以通過ABI或MegaBACE等測序儀進行檢測。通過收集每一個個體的相關信息,經軟體分析後即可得到結果。而採用Affymetrix公司的全基因組高密度的SNP晶元,操作更為簡單。每個個體的DNA經酶切、PCR擴增、熒游標記、雜交掃描後即可得到每個個體上萬個SNP的具體信息,經遺傳分析後就可得到定位結果,且定位的區域一般比微衛星定位的小很多。
㈤ 如何根據微衛星引物在NCBI裡面找到該位點的登記號或序列
現在NCBI中BLAST引物(注意選擇BLAST的資料庫),然後再Blast結果中找尋符合要求的序列。後面會列出很多鏈接,直接就能看到NCBI號
進入http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/Blast.cgi?PAGE=Nucleotides&PROGRAM=blastn&MEGABLAST=on&BLAST_PROGRAMS=megaBlast&PAGE_TYPE=BlastSearch&SHOW_DEFAULTS=on
在最上面的最大的空格里填上你要搜索的序列,如peimerA:「TCCCCAGCTGGAAGATGTGTCACG」(只填序列)在Database選擇資料庫,然後點最下面的BLAST按鈕。
結果中最符合的列在前面,一般就是想要的。
你做得是羅非魚?NCBI號是AF033802
㈥ 什麼是全基因組掃描其用途是什麼
遺傳分析仍是當前對致病相關基因識別、鑒定的主要方法,分為連鎖分析和關聯研究兩種。由於人類基因組多態性的研究以及SNP分型技術的發展,目前全基因組連鎖分析和關聯研究亦變得切實可行。根據研究規模的大小,可以將疾病遺傳分析分為以下幾類,即定位克隆、連鎖不平衡基因定位、全基因組候選基因分析、候選基因關聯研究和定位候選基因克隆,其中定位克隆、連鎖不平衡基因定位和全基因組候選基因分析均屬於全基因組掃描。
不管是單基因疾病還是多基因疾病,通常是先行全基因組掃描(genome scanning);將疾病相關位點定位於染色體某個區域,然後再行候選基因策略或連鎖不平衡分析,確定致病基因位點。如果利用家系進行連鎖分析,即採用定位克隆;若是利用群體樣本,則應用連鎖不平衡分析進行基因定位。全基因組掃描已成功地應用在許多疾病的致病相關基因克隆上,並取得了一定的成果。
全基因組掃描所利用的是在人類基因組大量存在的微衛星或SNP,雖然當前使用較多的仍是微衛星,但由於晶元技術的發展,全基因組高分布密度的商品化SNP晶元相繼面世(如Affymetrix公司的10k,100k和500k人基因組SNP晶元),越來越多的研究者使用SNP進行全基因組掃描。由於這些高密度的SNP晶元價格昂貴,不是一般的實驗室所能承受。
微衛星全基因組掃描的原理是利用特定的引物將某條染色體上特定位置的微衛星擴增出來,並進行分析。這種分析所使用的微衛星通常具有較高的多態性,在不同的個體其長度不盡相同(也就是微衛星基本單位重復次數的不同),而不同長度的PCR產物則代表某一位點不同的等位基因。該種分析方法實際上是利用平均分布於各條染色體上的密度約為10cM的微衛星,檢測每個微衛星是否存在與其鄰近的疾病相關基因座位連鎖。全基因組掃描並不能直接搜尋具體的疾病相關基因,而是通過研究均勻分布於整個基因組的微衛星標記來間接選擇其相關的基因座位。在得到陽性結果後,又可在這些陽性位點附近再加密微衛星標記或利用SNP,用同樣的方法來確定哪一個多態性位點與疾病連鎖的可能性最大等等。這樣在不斷地縮小分析范圍後,疾病相關基因定位的范圍也越來越精細。由於人類基因組序列已知,一旦發現了與疾病相關基因連鎖兩側的遺傳標記,根據標記位點的具體位置,我們就可以知道定位區域內所有的基因。因此,當定位區域確定後,在該區域內選擇候選基因直接進行測序,對所發現的突變在病人和對照組進行分型並分析,搜尋致病基因。另一個方法是直接從公共資料庫挑選候選基因編碼區、調控區(包括內含子)中的SNP,進行連鎖不平衡分析,確定致病基因。
㈦ 國內已上市的PD-1PD-L1葯物有哪些
通過資料庫中的「中國葯品批文資料庫」查詢了解,國內已上市的PD-1/PD-L1葯物共有10種,其中包含2款進口PD-1和2款進口的PD-L1,6款國產PD-1/PD-L1葯物。
國內已上市的PD-1/PD-L1葯物包含
君實生物:特瑞普利單抗注射液
阿斯利康:度伐利尤單抗注射液
BMS:納武利尤單抗注射液
信達生物:信迪利單抗注射液
默沙東:帕博利珠單抗注射液
百濟神州:替雷利珠單抗注射液
蘇州盛迪亞生物:注射用卡瑞利珠單抗
正大天晴/康方生物:派安普利單抗注射液
廣州譽衡生物/葯明生物:賽帕利單抗注射液
羅氏:阿替利珠單抗注射液
在資料庫的「全球葯物研發資料庫」中能了解葯物這些葯物的研發進展,研發階段、葯物類型、治療領域、化學數據等等,掌握PD-1/PD-L1葯物研發進展了解全球新葯研發趨勢;解決立項、評估等問題;制定企業的戰略規劃。
PD-1/L1葯物
以上就是國內已上市的PD-1/PD-L1葯物,PD-1(程序性死亡受體1),也稱為CD279(分化簇279),是一種重要的免疫抑制分子。通過向下調節免疫系統對人體細胞的反應,以及通過抑制T細胞炎症活動來調節免疫系統並促進自身耐受。這可以預防自身免疫性疾病,但它也可以防止免疫系統殺死癌細胞。