smx演算法
㈠ 計算機輔助葯物分子設計的目錄
第一章葯物研究及計算機輔助葯物分子設計1
第一節 葯物研究和開發的歷史及現狀1
第二節現代葯物研究的四大技術支柱3
一、分子生物學、基因組學及蛋白質組學3
二、組合化學5
三、高通量篩選6
四、與葯物研究相關的信息科學及技術7
第三節計算機輔助葯物分子設計11
一、概述11
二、CADD方法的分類12
第二章計算化學中的最優化方法17
第一節 引論17
一、 最優化問題概述17
二、 數學預備知識18
三、最優化條件26
第二節數值最優化方法30
一、最優化演算法的基本結構30
二、無約束問題的最優化方法33
第三章計算化學中的非數值最優化方法54
第一節引論54
一、計算復雜性54
二、局部搜索演算法56
三、組合優化問題演算法設計的思路58
第二節模擬退火63
第三節遺傳演算法77
第四節神經網路94
一、人工神經網路基本模型簡介94
二、用於優化計算的網路模型連續型Hopfield網路96
三、自組織網100
第四章分子力場和力場參數化106
第一節分子力場的勢函數形式108
第二節分子力場的分類115
一、 傳統力場115
二、第二代力場118
三、 通用力場120
四、其他力場121
第三節力場參數的擬合121
第五章構象分析方法139
第一節小分子的構象分析方法139
一、系統搜索方法139
二、片段連接方法142
三、隨機搜索方法143
四、距離幾何方法143
五、分子動力學方法146
六、基於遺傳演算法的構象分析方法148
第二節蛋白質結構的預測149
第六章分子動力學164
第一節積分方法165
第二節初始化167
第三節粒子受力的求算 169
第四節邊界條件173
第五節非鍵相互作用能的處理175
一、截斷值方法175
二、FMM方法177
三、Barnes?Huts演算法180
四、周期性邊界條件方法181
第六節約束條件動力學186
第七節恆溫和恆壓分子動力學188
第八節分子動力學軌跡分析189
第七章溶劑效應197
第一節顯示溶劑模型198
第二節連續介質模型199
一、表面加和模型199
二、泊松?玻耳茲曼模型202
三、GB/SA模型208
四、模型多級矩展開方法213
五、極化的連續介質模型213
六、SMx系列溶劑化模型215
第八章結合自由能計算218
第一節 引言218
一、 熵增加原理和Gibbs自由能218
二、受體?配體結合的親和力220
三、自由能計算方法的分類223
第二節自由能微擾和熱力學積分方法223
三、FEP和TI在葯物設計中的應用227
第三節基於主方程的自由能計算方法229
一、MM/PBSA方法的原理229
二、MM/PBSA方法的應用230
三、MM/PBSA方法的發展和完善232
第四節基於經驗方程的自由能預測234
一、B?hm的自由能預測模型234
二、Eldredge的自由能預測模型235
三、Head的自由能預測模型236
第五節LIE方法237
第九章定量構效關系方法研究246
第一節 二維定量構效關系方法246
一、Hansch法246
二、Free?Wilson法250
三、各種參數250
第二節建立定量構效關系模型的統計方法263
一、回歸分析263
二、遺傳演算法265
三、人工神經網路267
第三節三維定量構效關系方法268
一、距離幾何3D?QSAR268
二、分子形狀分析270
三、比較分子場分析方法272
四、虛擬受體方法277
第四節QSAR的應用281
一、2D?QSAR的應用281
二、3D?QSAR的應用287
參考文獻289
第十章 葯效團模型方法295
第一節葯效團模型的表達296
一、葯效特徵元素296
二、幾何約束299
第二節葯效團模型的識別300
一、葯效團識別的基本步驟301
二、分子疊合和活性構象301
第三節基於葯效團模型的資料庫搜索303
一、基於葯效團的資料庫搜索303
二、柔性構象搜索304
第四節葯效團識別系統305
一、Receptor305
二、Apex?3D306
三、DISCO307
四、GASP308
五、CATALYST309
六、幾種葯效團識別系統的性能比較311
第五節葯效團模型方法的應用314
一、Muscarinic M3受體拮抗劑的設計315
二、5?HT3受體拮抗劑的設計317
三、MC增生抑制劑的設計318
四、PKC抑制劑的設計319
五、HIV?1整合酶抑制劑的設計320
第十一章分子對接方法325
第一節分子對接的原理325
一、分子對接的理論基礎325
二、分子對接方法的分類326
三、分子對接方法中的重要問題326
第二節幾種有代表性的分子對接方法327
一、DOCK328
二、AUTODOCK332
三、FlexX335
四、Affinity337
五、LigandFit340
六、SFDOCK341
第三節虛擬篩選的策略343
第四節分子對接在葯物設計中的應用345
一、胸苷酸合成酶抑制劑的設計348
二、DHFR抑制劑的設計349
三、EGFR和抑制劑間相互作用模式的研究349
第十二章從頭設計方法354
第一節從頭設計方法的分類354
一、片段定位法355
二、位點連接法356
三、片段連接法357
四、逐步生長法360
第二節幾種重要的從頭設計方法362
一、GRID362
二、MCSS363
三、HINT365
四、LUDI366
五、Leapfrog369
第三節從頭設計在葯物開發中的應用371
一、fⅩa抑制劑的設計372
二、全新FKBP?12配體的設計373
第十三章分子三維結構資料庫和虛擬組合化學377
第一節三維結構資料庫378
一、劍橋結構資料庫379
二、國家癌症研究所380
三、Available Chemicals Directory 3D(ACD?3D)380
四、Available Chemicals Directory?Screening(ACD?SC)381
五、MDL Drug Data Report 3D(MDDR?3D)381
六、Comprehensive Medicinal Chemistry(CMC)381
七、類似物設計的結構資料庫BIOSTER382
八、Chapman & Hall Dictionary of Natural Proct(DNP)382
九、Metabolite382
十、Toxicity382
十一、中草葯三維結構資料庫383
第二節分子結構的拓撲表達和結構轉化385
一、分子結構的拓撲表達386
二、分子三維結構的轉化387
第三節資料庫搜索技術388
一、子結構匹配388
二、相似性搜索392
第四節重要的三維結構搜索系統395
一、MDL/Base395
二、Unity396
第五節計算組合化學方法396
第十四章葯代動力學特徵和毒性的預測405
第一節葯代動力學特徵的預測406
一、脂水分配系數406
二、腦血分配系數414
三、腸通透性420
四、水溶性422
第二節分子毒性的預測425
一、引論425
二、計算機輔助的化合物毒性預測方法427
三、常見化合物毒性預測軟體436
第十五章EGF?R和抑制劑間相互作用模式的研究447
第一節酪氨酸蛋白激酶447
一、PTK的結構特徵447
二、EGF?R的結構特徵448
三、EGF?R抑制劑的分類450
第二節苯胺喹唑啉類抑制劑的三維構效關系454
第三節EGF?R和喹唑啉類抑制劑結合模式的預測466
第十六章HIV?1蛋白酶抑制劑的設計476
第一節HIV?1病毒的結構和侵襲靶細胞的機制476
第二節基於HIV蛋白酶的抑制劑設計480
附錄一分子模擬方法中常用概念和名詞495
一、分子坐標表示495
二、分子表面498
三、分子圖形顯示模型500
四、量化計算常見術語簡介502
附錄二葯物分子設計中常用軟體列表505
1?大型分子模擬軟體系統505
2?小型分子模擬軟體系統507
3?小型葯物設計軟體系統508
4?常用量化計算軟體509
5?分子力學、分子動力學和蒙特卡羅模擬軟體510
6?QSAR和分子參數計算軟體513
7?葯效團模擬軟體518
8?分子對接軟體519
9?從頭設計方法522
10?分子相似性和差異性分析以及組合庫設計524
11?葯代動力學和毒性預測軟體526
12?蛋白質三維結構模建、結構評估和活性位點預測軟體529
13?資料庫搜索軟體532
14?分子疊合532
15?二維轉三維和文件格式轉換軟體533
16?分子顯示軟體534
17?求解PB方程的軟體536
18?化學軟體開發包536
19?國內主要軟體代理商的相關信息537
㈡ 銀河麒麟V10交換分區是什麼意思
銀河麒麟高級伺服器操作系統V10是針對企業級關鍵業務,適應虛擬化、雲計算、大數據、工業互聯網時代對主機系統可靠性、安全性、性能、擴展性和實時性的需求,依據CMMI 5級標准研製的提供內生安全、雲原生支持、國產平台深入優化、高性能、易管理的新一代自主伺服器操作系統;同源支持飛騰、龍芯、申威、兆芯、海光、鯤鵬等自主CPU及x86平台;可支撐構建大型數據中心伺服器高可用集群、負載均衡集群、分布式集群文件系統、虛擬化應用和容器雲平台等,可部署在物理伺服器和虛擬化環境、私有雲、公有雲和混合雲環境;應用於政府、國防、金融、教育、財稅、公安、審計、交通、醫療、製造等領域。
同源優化支持自主CPU
同源構建支持六大國產平台,內核、核心庫和桌面環境等所有組件基於同一套源代碼構建,並面向各自主CPU及伺服器整機進行了針對性優化適配,為不同平台的軟硬體生態提供兼容一致的開發和運行介面,為管理員提供一致的運維管理體驗。
一體化內生本質安全
基於自主軟硬體、密碼技術的內核與應用一體化的內生本質安全體系:自研內核安全執行控制機制KYSEC、生物識別管理框架和安全管理工具,支持多策略融合的強制訪問控制機制;支持國密演算法SMx和可信計算TCM/TPCM、TPM2.0等;達到GB/T 20272第四級、B+級安全技術要求。
虛擬化及雲原生支持,優化支持KVM、Docker、LXC虛擬化,以及Ceph、GlusterFS、OpenStack、k8s等原生技術生態,實現對容器、虛擬化、雲平台、大數據等雲原生應用的良好支持。
高可用性,通過XFS文件系統、備份恢復、網卡綁定、硬體冗餘等技術和配套磁碟心跳級高可用集群軟體,實現主機系統和業務應用的高可用保護。國產平台深入優化支持,針對不同自主CPU平台在內核安全、RAS特性、IO性能、虛擬化和國產硬體(橋片、網卡、顯卡、AI卡、加速卡等)及驅動支持等方面優化增強,以及工控機支持。
可管理性,提供圖形化管理工具和統一的綜合管理平台(SystemCenter),實現對物理伺服器集群運行狀態的監控及預警、對虛擬化集群的配置及管控、對高可用集群的策略定製和資源調配等功
㈢ 銀河麒麟操作系統V10的特點是什麼
中國電子近日發布銀河麒麟操作系統V10,該系統充分適應5G時代需求,打通了手機、平板電腦、PC等,實現多端融合。麒麟操作系統獨創的kydroid技術,可以原生支持海量安卓應用,將300萬餘款安卓適配軟硬體無縫遷移到國產平台上來。
銀河麒麟操作系統並非「橫空出世」。在此之前,銀河麒麟操作系統已經連續9年位列中國Linux市場佔有率第一名,在嫦娥探月、國家電網、北京地鐵、航空公司客票系統中都發揮了重要作用。目前,已有1千家以上國內外主流生態企業在麒麟操作系統V10上完成了超過1萬款的軟硬體產品適配。
(3)smx演算法擴展閱讀
銀河麒麟V10的發布受廣泛關注的原因
1、近期美國挑釁不斷,中國企業面臨操作系統或遭禁令扼喉的威脅,自主操作系統的重要性因此陡然提升。
2、銀河麒麟操作系統雖然已經研發了幾十年,開始商用也已十幾年,但主要應用在伺服器端。而最新發布的銀河麒麟操作系統V10,卻有面向5G時代、面向個人終端、面向多端融合的強烈技術色彩,正好可以彌補自主操作系統的短板。
㈣ 基於Cortex-M33的LPC55xx系列支持SMX演算法嗎
LPC55是沒有SMX演算法的完整硬體支持的。
㈤ ANSYS應力圖各字母什麼意思
Nodal Solution 表示你的應力雲圖是基於節點的解進行插值繪出的
Sub=1表示第一個求解子步
Time=1表示第一個時間步,通常單位是秒
SEQV (AVG)表示等效應力的節點解的臨近單元應力磨平演算法的泛函解,等效應力又稱馮米塞斯應力
DMX表示最大位移解
SMN表示最小應力解
SMX表示最大應力解
SMXB忘了。。。。不好意思這個我用的少